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Enregistrement W4379600435 · doi:10.1093/brain/awad187

Genetic analysis and natural history of Charcot-Marie-Tooth disease CMTX1 due to <i>GJB1</i> variants

2023· article· en· W4379600435 sur OpenAlex
Christopher J. Record, Mariola Skorupinska, Matilde Laurá, Alexander M. Rossor, Davide Pareyson, Chiara Pisciotta, Shawna Feely, Thomas E. Lloyd, Rita Horváth, Reza Sadjadi, David N. Herrmann, Jun Li, David Walk, Richard A. Lewis, John Day, Joshua Burns, Richard S. Finkel, Mario Saporta, Sindhu Ramchandren, Michael D. Weiss, Gyula Acsádi, Vera Fridman, Francesco Muntoni, Roy Poh, James M. Polke, Stephan Züchner, Michael E. Shy, Steven S. Scherer, Mary M. Reilly, Lisa Abreu, Kimberly A Anderson, Silvia Baratta, Debbie Berry, Julian Blake, Eleonora Cavalca, Kayla Cornett, Andrea Cortese, Gabrielle Donlevy, Amanda Dragon, Magdalena Dudziec, Katy Eichinger Tim Estilow, Valerie Ferment, Natalie Grant, Tiffany Grider, Emily Hyslop, Tara Jones, Nicole Kressin, Wendy Leon, Stefania Magri, Brett A. McCray, Manoj P. Menezes, Evelin Milev, Lindsey Parrott, Pooja P. Patel, Cláudia Brito Pires, Valeria Prada, Gita Ramdharry, Paola Saveri, Giulia Schirinzi, Rosemary Shy, Carly E. Siskind, Janet E. Sowden, Sydney Stork, Charlotte J. Sumner, Franco Taroni, Simone Thomas, Jennifer Twachtman‐Bassett, Nidia Villalpando, Dragan Vujović, Julie Wells, Elizabeth Wood, Riccardo Zuccarino

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueBrain · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueHereditary Neurological Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilMedical Research Council CanadaNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute for Health and Care ResearchArgenxCharcot-Marie-Tooth AssociationUniversity of Minnesota FoundationMuscular Dystrophy AssociationSarepta TherapeuticsMinistero della SalutePfizerAustralian GovernmentUniversity of MinnesotaWayne State UniversityMitsubishi Tanabe Pharma CorporationWellcome TrustAlexion PharmaceuticalsMedical Research CouncilBiogen
Mots-clésMissense mutationGenotypeDiseasePhenotypeGenetic variantsGeneticsInternal medicineMedicineLongitudinal studyBiologyGenePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Charcot-Marie-Tooth disease (CMT) due to GJB1 variants (CMTX1) is the second most common form of CMT. It is an X-linked disorder characterized by progressive sensory and motor neuropathy with males affected more severely than females. Many reported GJB1 variants remain classified as variants of uncertain significance (VUS). In this large, international, multicentre study we prospectively collected demographic, clinical and genetic data on patients with CMT associated with GJB1 variants. Pathogenicity for each variant was defined using adapted American College of Medical Genetics criteria. Baseline and longitudinal analyses were conducted to study genotype-phenotype correlations, to calculate longitudinal change using the CMT Examination Score (CMTES), to compare males versus females, and pathogenic/likely pathogenic (P/LP) variants versus VUS. We present 387 patients from 295 families harbouring 154 variants in GJB1. Of these, 319 patients (82.4%) were deemed to have P/LP variants, 65 had VUS (16.8%) and three benign variants (0.8%; excluded from analysis); an increased proportion of patients with P/LP variants compared with using ClinVar's classification (74.6%). Male patients (166/319, 52.0%, P/LP only) were more severely affected at baseline. Baseline measures in patients with P/LP variants and VUS showed no significant differences, and regression analysis suggested the disease groups were near identical at baseline. Genotype-phenotype analysis suggested c.-17G>A produces the most severe phenotype of the five most common variants, and missense variants in the intracellular domain are less severe than other domains. Progression of disease was seen with increasing CMTES over time up to 8 years follow-up. Standard response mean (SRM), a measure of outcome responsiveness, peaked at 3 years with moderate responsiveness [change in CMTES (ΔCMTES) = 1.3 ± 2.6, P = 0.00016, SRM = 0.50]. Males and females progressed similarly up to 8 years, but baseline regression analysis suggested that over a longer period, females progress more slowly. Progression was most pronounced for mild phenotypes (CMTES = 0-7; 3-year ΔCMTES = 2.3 ± 2.5, P = 0.001, SRM = 0.90). Enhanced variant interpretation has yielded an increased proportion of GJB1 variants classified as P/LP and will aid future variant interpretation in this gene. Baseline and longitudinal analysis of this large cohort of CMTX1 patients describes the natural history of the disease including the rate of progression; CMTES showed moderate responsiveness for the whole group at 3 years and higher responsiveness for the mild group at 3, 4 and 5 years. These results have implications for patient selection for upcoming clinical trials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,929
Score d'incertitude au seuil0,533

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle