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Enregistrement W4379645505 · doi:10.1261/rna.079613.123

Which came first: the chicken, the egg, or guanine?

2023· article· en· W4379645505 sur OpenAlexfundno aff
Besik Kankia

Notice bibliographique

RevueRNA · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of California, San DiegoSimon Fraser UniversityOhio State University
Mots-clésBiologyExtant taxonBootstrapping (finance)DarwinismEvolutionary biologyTranslation (biology)Cognitive scienceGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The main goal of the origin of life (OoL) hypothesis is to reconstruct the missing link between the primordial soup and the extant biology. However, the OoL itself is just the initial part of the link representing the bootstrapping operation of Darwinian evolution. The rest of the link is the emergence of the evolution to the present day primary biological system-the ribosome-based translation apparatus. A valid hypothesis must (i) not invoke Darwinian evolution in the bootstrapping and (ii) transform the ab initio life form into the translation apparatus without violating the principle of continuity (i.e., only incremental steps without foresight). Currently, no such hypothesis exists. Here, I discuss the Quadruplex World hypothesis, which fully complies with these requirements and suggests a spontaneous emergence of the ab initio life form. The spontaneity of OoL arises from the physicochemical properties of guanine monomers in a manner of causal determinism: each step of the process (i.e., scaffolding, polymerization, and folding) is caused by the most recent past step such that in the end only the specific 3D architecture forms. The architecture (i) has a length-independent folding pattern; (ii) can play the role of the predecessor of tRNA and single-handedly conduct a primitive form of translation; and (iii) can evolve into the extant translation apparatus without any paradoxes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,422
Score d'incertitude au seuil0,392

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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