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Enregistrement W4379653795 · doi:10.25259/jhas_37_2022

Rare mutations in the beta-globin gene and their clinical phenotypes

2023· article· en· W4379653795 sur OpenAlexaboutno aff
Sunistha Bhattacharjee, Shouriyo Ghosh, Rudra Ray, Maitreyee Bhattacharyya

Notice bibliographique

RevueJournal of Hematology and Allied Sciences · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHemoglobinopathies and Related Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutationGeneticsBeta thalassemiaGene mutationCompound heterozygosityBiologyPolymerase chain reactionHemoglobin variantsThalassemiaGeneHemoglobinopathyDNA sequencingGenetic diagnosisMedicineHemoglobinHemolytic anemiaImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objectives: Beta-thalassemia is one of the most common inherited genetic disorders and the repertoire of mutations in the beta-globin gene is ever-expanding. Sequencing for beta-globin gene mutations, is done, where phenotype-high-performance liquid chromatography discrepancies exist or where amplification refractory mutation system – polymerase chain reaction (ARMS-PCR) cannot identify common mutations, and often leads to the discovery of rare and novel mutations. Materials and Methods: This is a retrospective data analysis of 160 patients of beta-thalassemia and other hemoglobinopathies where some patients were found to have unexplained clinical features. Comprehensive genetic diagnosis was done on these patients by ARMS-PCR, gap-polymerase chain reaction, and sequencing. Results: Out of the total, 124 cases were homozygous/compound heterozygous for beta-thalassemia; 26 cases had heterozygous beta mutations with coexistent alpha-triplications and four patients (with unique clinical features) were found to harbor five rare mutations. The mutations detected were hemoglobin (Hb) Monroe (co-occurring with beta nt-42 mutation), beta-globin mutation −90(C>T), Hb Randwick, and Hb-M-Saskatoon (a variant hemoglobin causing methemoglobinemia and cyanosis). The spectrum of common mutations detected, in our study, was similar to that published in the literature. The unique clinical features of the patients were conclusively explained by the sequencing results. Conclusion: This study emphasizes the role of sequencing in the genetic diagnosis of beta-thalassemia. As next-generation sequencing increasingly finds use in routine diagnostics, newer clinically significant mutations will continue to be added to the large palette of mutations in beta-thalassemia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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