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Enregistrement W4379768485 · doi:10.1038/s41598-023-36129-w

A case study of an individual participant data meta-analysis of diagnostic accuracy showed that prediction regions represented heterogeneity well

2023· review· en· W4379768485 sur OpenAlexafffund
Aurelio López Malo Vázquez de Lara, Parash Mani Bhandari, Yin Wu, Brooke Levis, Brett D. Thombs, Andrea Benedetti, Chen He, Ankur Krishnan, Dipika Neupane, Zelalem Negeri, Mahrukh Imran, Danielle B. Rice, Kira E. Riehm, Nazanin Saadat, Marleine Azar, Jill Boruff, Pim Cuijpers, Simon Gilbody, John P. A. Ioannidis, Lorie A. Kloda, Dean McMillan, Scott B. Patten, Ian Shrier, Roy C. Ziegelstein, Dickens Akena, Bruce Arroll, Liat Ayalon, Hamid Reza Baradaran, Anna Beraldi, Charles H. Bombardier, Peter Butterworth, Gregory Carter, Marcos Hortes Nisihara Chagas, Juliana C.N. Chan, Rushina Cholera, Neerja Chowdhary, Kerrie Clover, Yeates Conwell, Janneke M. de Man‐van Ginkel, Jaime Delgadillo, Jesse R. Fann, Felix Fischer, Daniel Fung, Bizu Gelaye, Felicity Goodyear‐Smith, Catherine G. Greeno, Brian J. Hall, Martin Härter, Ulrich Hegerl, Leanne Hides, Stevan E. Hobfoll, Marie Hudson, Thomas Hyphantis, Masatoshi Inagaki, Khalida Ismail, Nathalie Jetté, Mohammad E. Khamseh, Kim M. Kiely, Yunxin Kwan, Femke Lamers, Shen‐Ing Liu, Manote Lotrakul, Sônia Regina Loureiro, Bernd Löwe, Laura Marsh, Anthony McGuire, Sherina Mohd Sidik, Tiago N. Munhoz, Kumiko Muramatsu, Flávia de Lima Osório, Vikram Patel, Brian W. Pence, Philippe Persoons, Angelo Picardi, Katrin Reuter, Alasdair G Rooney, Iná S. Santos, Juwita Shaaban, Abbey Sidebottom, Adam Simning, Lesley Stafford, Sharon C. Sung, Pei Lin Lynnette Tan, Alyna Turner, Christina M. van der Feltz‐Cornelis, Henk van Weert, Paul A. Vöhringer, Jennifer White, Mary A. Whooley, Kirsty Winkley, Mitsuhiko Yamada, Yuying Zhang

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2023
Typereview
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueMeta-analysis and systematic reviews
Établissements canadiensUniversity of CalgaryConcordia UniversityMcGill University Health CentreMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Center for Medical Rehabilitation ResearchCanadian Arthritis NetworkEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Cancer InstituteNational Institute of Mental HealthFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchPfizerUniversity of WashingtonNational Institute on Disability and Rehabilitation ResearchAgency for Healthcare Research and QualityH. Lundbeck A/SSafe Work AustraliaJewish General HospitalNational Health and Medical Research CouncilUniversidade de São PauloHealth Research Council of New ZealandNational Health Research InstitutesUniversidade de MacauNational Institutes of HealthTehran University of Medical Sciences and Health ServicesMitacsChinese Diabetes SocietyMcGill UniversityConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoNational Heart, Lung, and Blood InstituteMedical Research CouncilUniversiti Putra MalaysiaNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesCenters for Disease Control and PreventionMahidol UniversityAlberta Innovates - Health SolutionsZonMwEli Lilly and CompanyUniversity of AucklandNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesEuropean CommissionBundesministerium für Bildung und ForschungAlberta InnovatesNational Institute for Health and Care ResearchScleroderma Society of OntarioAlberta Health ServicesMinistry of Health, Labour and WelfareProgramme Grants for Applied ResearchMcGill University Health CentreInstitut de recherche, Centre universitaire de santé McGillDeutsche RentenversicherungUniversität HeidelbergBanco SantanderFaculty of Medicine, McGill UniversityOhio Board of RegentsCumming School of Medicine, University of CalgaryFundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul
Mots-clésMeta-analysisComputer scienceDiagnostic accuracyData miningArtificial intelligenceStatisticsData scienceComputational biologyMedicineMathematicsBiologyPathologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The diagnostic accuracy of a screening tool is often characterized by its sensitivity and specificity. An analysis of these measures must consider their intrinsic correlation. In the context of an individual participant data meta-analysis, heterogeneity is one of the main components of the analysis. When using a random-effects meta-analytic model, prediction regions provide deeper insight into the effect of heterogeneity on the variability of estimated accuracy measures across the entire studied population, not just the average. This study aimed to investigate heterogeneity via prediction regions in an individual participant data meta-analysis of the sensitivity and specificity of the Patient Health Questionnaire-9 for screening to detect major depression. From the total number of studies in the pool, four dates were selected containing roughly 25%, 50%, 75% and 100% of the total number of participants. A bivariate random-effects model was fitted to studies up to and including each of these dates to jointly estimate sensitivity and specificity. Two-dimensional prediction regions were plotted in ROC-space. Subgroup analyses were carried out on sex and age, regardless of the date of the study. The dataset comprised 17,436 participants from 58 primary studies of which 2322 (13.3%) presented cases of major depression. Point estimates of sensitivity and specificity did not differ importantly as more studies were added to the model. However, correlation of the measures increased. As expected, standard errors of the logit pooled TPR and FPR consistently decreased as more studies were used, while standard deviations of the random-effects did not decrease monotonically. Subgroup analysis by sex did not reveal important contributions for observed heterogeneity; however, the shape of the prediction regions differed. Subgroup analysis by age did not reveal meaningful contributions to the heterogeneity and the prediction regions were similar in shape. Prediction intervals and regions reveal previously unseen trends in a dataset. In the context of a meta-analysis of diagnostic test accuracy, prediction regions can display the range of accuracy measures in different populations and settings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,159
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,392
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,841
Score d'incertitude au seuil0,839

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1590,392
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0080,038
Bibliométrie0,0070,009
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0050,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,962
Tête enseignante GPT0,620
Écart entre enseignants0,341 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
DomaineMéthodes
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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