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Enregistrement W4379768581 · doi:10.1111/nph.19048

<scp>SlERF</scp>.<scp>H6</scp> mediates the orchestration of ethylene and gibberellin signaling that suppresses <scp>bitter‐SGA</scp> biosynthesis in tomato

2023· article· en· W4379768581 sur OpenAlexfundno aff
Yingchen Hao, Lijun Xiang, Jun Lai, Chun Li, Yue Zhong, Weizhen Ye, Jie Yang, Jun Yang, Shouchuang Wang

Notice bibliographique

RevueNew Phytologist · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePotato Plant Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHenan UniversityInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesHainan UniversityInstitute of GeneticsNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiosynthesisGibberellinBiochemistryGlycoalkaloidCrosstalkChemistryMetabolic pathwayBiologyMetabolismCell biologyGeneGeneticsSolanaceae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Steroidal glycoalkaloids (SGAs) constitute a characteristic class of antinutritional metabolites that are found in certain Solanum species. Despite the considerable studies on SGA biosynthesis, the mechanisms of crosstalk between hormone signaling pathways that regulate SGA content still remain to be elucidated. Here, we performed a metabolic genome‐wide association study (mGWAS) based on the levels of SGA metabolites and identified SlERF.H6 as a negative regulator of bitter‐SGA biosynthesis. SlERF.H6 repressed the expression of SGA biosynthetic glycoalkaloid metabolism ( GAME ) genes and caused a subsequent decrease in the abundance of bitter SGAs. Furthermore, SlERF.H6 were shown to act downstream of GAME9, a regulator of SGA biosynthesis in tomato. We also uncovered the interplay between ethylene and gibberellin (GA) signaling in regulating SGA biosynthesis. SlERF.H6, acting as a downstream component in ethylene signaling, modulated GA content by inhibiting SlGA2ox12 expression. Increasing levels of endogenous GA 12 and GA 53 in SlERF.H6‐OE could inhibit of GA on SGA biosynthesis. Additionally, 1‐aminocyclopropane‐1‐carboxylic acid (ACC) treatment decreased the stability of SlERF.H6, weakening its inhibition on GAME genes and SlGA2ox12 , and caused bitter‐SGA accumulation. Our findings reveal a key role of SlERF.H6 in the regulation of SGA biosynthesis through the coordinated ethylene‐gibberellin signaling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,133
Score d'incertitude au seuil0,684

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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