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Enregistrement W4379966399 · doi:10.1038/s41598-023-33547-8

Microcalcification crystallography as a potential marker of DCIS recurrence

2023· article· en· W4379966399 sur OpenAlexaff
Sarah Gosling, Emily L. Arnold, Samantha K. Davies, Hannah L. Cross, Ihssane Bouybayoune, Doriana Calabrese, Jayakrupakar Nallala, Sarah E. Pinder, Liping Fu, Esther H. Lips, Lorraine King, Jeffrey R. Marks, Allison Hall, Lars J. Grimm, Thomas R. Lynch, Donna Pinto, Hilary Stobart, E. Shelley Hwang, Jelle Wesseling, Kalotina Geraki, Nicholas Stone, Iain Lyburn, Charlene Greenwood, Keith D. Rogers, Alastair M. Thompson, Serena Nik‐Zainal, Elinor J. Sawyer, Helen Davies, P. Andrew Futreal, Nicholas E. Navin, Jos Jonkers, Jacco van Rheenen, Fariba Behbod, Marjanka K. Schmidt, Lodewyk F.A. Wessels, Daniel Rea, Proteeti Bhattacharjee, Deborah Collyar, Ellen Verschuur, Marja van Oirsouw

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueAdvanced X-ray and CT Imaging
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesCancer Research UKMedical Research CouncilKWF KankerbestrijdingDiamond Light Source
Mots-clésMicrocalcificationWhitlockiteMedicineBreast cancerDuctal carcinomaCalcificationCarcinoma in situPathologyOncologyInternal medicineCancerMammographyCalcium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ductal carcinoma in-situ (DCIS) accounts for 20-25% of all new breast cancer diagnoses. DCIS has an uncertain risk of progression to invasive breast cancer and a lack of predictive biomarkers may result in relatively high levels (~ 75%) of overtreatment. To identify unique prognostic biomarkers of invasive progression, crystallographic and chemical features of DCIS microcalcifications have been explored. Samples from patients with at least 5-years of follow up and no known recurrence (174 calcifications in 67 patients) or ipsilateral invasive breast cancer recurrence (179 microcalcifications in 57 patients) were studied. Significant differences were noted between the two groups including whitlockite relative mass, hydroxyapatite and whitlockite crystal maturity and, elementally, sodium to calcium ion ratio. A preliminary predictive model for DCIS to invasive cancer progression was developed from these parameters with an AUC of 0.797. These results provide insights into the differing DCIS tissue microenvironments, and how these impact microcalcification formation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,455
Score d'incertitude au seuil0,400

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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