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Enregistrement W4379981126 · doi:10.1002/hon.3164_453

Analyses of a patient with 3 sequential Post Transplant Lymphoprolierative Disease (PTLD) biopsies reveal persistence of Histone 1 gene mutation, suspected to mediate PTLD

2023· article· en· W4379981126 sur OpenAlexaff
Bo‐Yee Ngan, Angela Punnett, Robert Siddaway, Cynthia Hawkins, Melinda Solomon

Notice bibliographique

RevueHematological Oncology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHistopathologyLymphomaBiologyPathologyTonsilRituximabLymphomatoid granulomatosisCancer researchMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Post allograft transplant patients are prone to develop a continuum of lympho-proliferative diseases (PTLD) that exhibit distinct clinicopathological forms that range from benign to malignant. The molecular pathogenesis of PTLD is not well established. Methods: We analyzed an unusual case of a 15 year old child who received a lung transplant at age 7 and developed PTLD first in the right tonsil (polymorphic PTLD) 4 months post transplant and then in the left shin and associated lymph node (PTLD-Burkitt Lymphoma) 4 years later. Histopathology and immunohistopathology (IHC) features of the left shin mass were typical for Burkitt Lymphoma with diagnostic features of CD20+, CD10+ve, TdT-ve, EBER+ve, IGH clonal for B cells and Ig-cMyc fusion positve by FISH analysis. The child received chemotherapy and was in remission for 3 years. At 8 years post transplant, he developed an enlargement of the left tonsil. Histopathology and IHC lack evidence of recurrent Burkitt Lymphoma as the B cells are polyclonal, CD10-ve and EBV-ve. FISH was negative for Ig-cMyc fusion. A diagnosis of a polymorphic PTLD was made. With the recently available TruSight RNA Pan-Cancer assay, RNA was extracted from the two most recent tissue samples and NGS libraries were enriched using the 1385 gene panel. Results show the PTLD- Burkitt Lymphoma has additional mutations in the cMyc locus and TP53. The distinctly common mutations notable for Pediatric Burkitt Lymphoma in immunocompetent patients such as ID3, DDX3X, ARID1A and SMARCA4 that are noted in our database and described in a recent publication by B. Burkhardt et al (Nature communication 13:3881;2022) are absent. cMyc, TP53 and all of these mutations are absent in the post chemotherapy polymorphic PTLD in the right tonsil. However, a mutation of Linker Histone 1 (H1-4) gene is detected in the Burkitt PTLD mass and this recurrent polymorphic PTLD tonsil. Conclusions: This result shows there is a persistence of non clonal B cells that are chemotherapy resistant. The patient is currently stable under clinical surveillance. The pathological consequence of H1ST-1(1-4) mutation in the B cells of this patient appears to be supported by a study in a preclinical mouse model that Histone H1 loss drives lymphoma by disrupting 3D chromatin structure (N. Yusufova et. al. Nature 589:299-305; 2021). In this study, knock-in mice carying this mutation alone have prolonged survival as compared with knock-in mice with genetic constructs that contain additional oncogenic driver genes. Based on our findings of the persistence of lymphoid cells with a mutation of gene encoding for a epigenomic gene[HIST-1 (1-4) ], we suspect this mutation plays a role that drives the development of PTLD in this patient. Keywords: Diagnostic and Prognostic Biomarkers, Non-Hodgkin (Pediatric, Adolescent, and Young Adult), Pathology and Classification of Lymphomas No conflicts of interests pertinent to the abstract.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,088
Score d'incertitude au seuil0,515

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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