Biological and clinical relevance of CD79 protein and gene expression in diffuse large B‐cell lymphoma
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: CD79B is a target of polatuzumab vedotin, an antibody–drug conjugate, which may improve the prognosis of both previously untreated and relapsed/refractory patients with diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL). However, the biological and clinical significance of CD79B protein and gene expression in DLBCL is largely unknown. Methods: We retrospectively analyzed de novo DLBCL patients, who were diagnosed and received rituximab-based immunochemotherapy from 2008 through 2018 in the Okayama Hematology Study Group from Japan. Immunohistochemistry (IHC) staining was performed using a CD79B antibody (AT107-2), and protein expression was assessed based on H-score according to a previous study (Sehn L et al. JCO 2020). We also performed gene expression profile-based cell-of-origin (COO) classification, including double-hit signature (DHITsig) which has been renamed to dark zone signature (DZsig) (Waleed A et al. Blood 2022), using the NanoString DLBCL90 assay. Results: CD79B IHC expression was evaluable in 602 cases. We idefined two groups according to median H-score of CD79B expression: CD79Bhigh and CD79Blow. The COO subtypes were assigned as follows: 308 patients (51%) with activated B-cell-like (ABC)-DLBCL, 196 (33%) with germinal center B-cell-like (GCB)-DLBCL, 32 (5%) with DZsig-pos DLBCL and 66 (11%) with unclassified (UNC). H-score of CD79B was the lowest in patients with ABC-DLBCL followed by GCB-DLBCL and DZsig-pos DLBCL in ascending order (Kruskal–Wallis test P < .00001; Figure A). Indeed, CD79Blow tumors were significantly enriched in ABC-DLBCL (57%) compared to GCB-DLBCL (40%) and DZsig-pos DLBCL (22%), respectively (both, P < .001). Consistently, using publicly available DLBCL datasets (Schmitz et al. NEJM 2018 and Ennishi et al. JCO 2019), we revealed that CD79B gene expression was the lowest in ABC-DLBCL compared to GCB- and DHITsig-DLBCL (Kruskal–Wallis test P = .01; Figure B and C). The association of CD79B expression with COO prompted us to evaluate CD79B expression in normal germinal center B cells. Notably single-cell transcriptomic analyses of six reactive lymphoid tissues from publicly available datasets revealed that the lowest expression of CD79B was found in plasmablasts followed by light zone B cells and dark zone B cells in ascending order (Kruskal–Wallis test P < .0001), supporting the differential expression of CD79Baccording to COO subtype. CD79Blow group had significantly shorter overall survival (OS) in the total DLBCL cohort (log-rank, P < .001) and within ABC-DLBCL (P = .001, Figure D and E). Moreover, CD79B protein expression was significantly associated with OS after adjusting for International Prognostic Index in the total cohort (Cox regression model; P< .001). Keywords: Aggressive B-cell non-Hodgkin lymphoma, Diagnostic and Prognostic Biomarkers Conflicts of interests pertinent to the abstract. K. Sunami Honoraria: Celgene, Sanofi, BMS, Ono, Janssen Research funding: Takeda, AbbVie, GSK, Chugai, Otsuka, MSD, Novartis, Astellas Amgen, Pfizer, Parexel, Kyowa Kirin, Symbio, Agios Y. Hiramatsu Honoraria: Chugai Pharmaceutical Co, Nippon Shinyaku Co, Bristol Myers Squibb, Sanofi K.K. I. Yoshida Honoraria: Kyowa Kirin, Chugai, Eisai, Jannsen, Nippon-shinyaku, Otsuka, Symbio, Takeda, Sumitomo Pharma, Meiji Research funding: Kyowa Kirin, Chugai Y. Maeda Research funding: Chugai, Nippon-shinyaku Other remuneration: Chugai, Eisai, Otsuka, Kyowa Kirin, Takeda D. W. Scott Consultant or advisory role: Abbvie, AstraZeneca, Janssen, Incyte Honoraria: AstraZeneca Research funding: Janssen, Roche/Genentech D. Ennishi Honoraria: Chugai, Eisai, Kyowa Kirin Research funding: Nipponshinyaku, Chugai
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».