Cellular RNA levels define heterotrophic substrate-uptake rate sub-guilds in activated sludge microbial communities
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
A heterotrophic-specialist model was proposed previously to divide wastewater treatment plant (WWTP) heterotrophs into sub-guilds of consumers of readily or slowly degradable substrates (RDS or SDS, respectively). The substrate degradation rate model coupled to metabolic considerations predicted that RNA and polyhydroxyalkanoate (PHA) levels would be positively correlated in the activated sludge communities with high RNA and PHA occurring in RDS-consumers, and low RNA with no PHA accumulation occurring in SDS-consumers because their external substrates are always present. This prediction was verified in previous studies and in the current one. Thus, RNA and PHA levels were used as biomarkers of the RDS- and SDS-consumer sub-guilds for cell sorting using flow cytometry of samples from three WWTPs. Subsequently, 16S rRNA gene amplicon sequencing revealed that the sorted groups were highly similar over time and among WWTPs, and demonstrated a clear segregation by RNA levels. Predicted ecophysiological traits based on 16S rRNA phylogeny suggested that the high-RNA population showed RDS-consumer traits such as higher rrn copy numbers per genome. Using a mass-flow immigration model, it appeared that the high-RNA populations exhibited high immigration rates more frequently than low-RNA populations, but the differences in frequencies were less with increasing solids residence times.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle