Correlation between dehydrin-like proteins and cold hardiness of grapevine
Notice bibliographique
Résumé
Winter survival of Vitis vinifera Linnaeus in cool climate viticultural areas can be jeopardized due to inadequate cold hardiness. Dehydrins are a family of proteins commonly found in plant tissue in response to dehydration stress and cold exposure. To determine their presence and relationship to cold hardiness in overwintering grapevines, compound buds of V. vinifera cv. Sauvignon blanc were sampled from a commercial vineyard every 2–3 weeks throughout the 2016–2017 winter. Proteins were extracted and separated by SDS–PAGE, and potential dehydrins were immunoblotted with a commercial antibody raised against the dehydrin K-segment consensus sequence. Six protein bands were identified in four Sauvignon blanc clones at 23, 26, 35, 41, 48, and 90 kDa, showing a serological relation to dehydrins due to their reaction with the K-segment antibody. The bands at 23, 41, 48, and 90 kDa were confirmed as dehydrins following trypsin digestion and liquid chromatography with tandem mass spectrometry with Mascot analysis. Their fluctuations throughout the dormant season were quantified by immunoblotting, and three patterns emerged, the 23, 26, and 35 kDa proteins peaked immediately prior to deacclimation; the 41 and 48 kDa proteins peaked during maximum hardiness and decreased towards deacclimation, while the 90 kDa plateaued during the same period. Maximum hardiness and relative dehydrin band intensity were positively correlated ( p < 0.050) for all but the 23 kDa protein. The variation in accumulation patterns and relationships to cold hardiness indicates that these dehydrin proteins are likely regulated by different molecular processes and could play different roles in cryoprotection throughout dormancy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».