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Enregistrement W4380089118 · doi:10.1139/cjps-2023-0048

Correlation between dehydrin-like proteins and cold hardiness of grapevine

2023· article· en· W4380089118 sur OpenAlexafffundvenue
Andréanne Hébert-Haché, James Willwerth, Belinda Kemp, Debra Inglis

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueHorticultural and Viticultural Research
Établissements canadiensBrock University
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésHardiness (plants)VineyardOverwinteringHorticultureBotanyVitis viniferaBiologyChemistryCultivar

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Winter survival of Vitis vinifera Linnaeus in cool climate viticultural areas can be jeopardized due to inadequate cold hardiness. Dehydrins are a family of proteins commonly found in plant tissue in response to dehydration stress and cold exposure. To determine their presence and relationship to cold hardiness in overwintering grapevines, compound buds of V. vinifera cv. Sauvignon blanc were sampled from a commercial vineyard every 2–3 weeks throughout the 2016–2017 winter. Proteins were extracted and separated by SDS–PAGE, and potential dehydrins were immunoblotted with a commercial antibody raised against the dehydrin K-segment consensus sequence. Six protein bands were identified in four Sauvignon blanc clones at 23, 26, 35, 41, 48, and 90 kDa, showing a serological relation to dehydrins due to their reaction with the K-segment antibody. The bands at 23, 41, 48, and 90 kDa were confirmed as dehydrins following trypsin digestion and liquid chromatography with tandem mass spectrometry with Mascot analysis. Their fluctuations throughout the dormant season were quantified by immunoblotting, and three patterns emerged, the 23, 26, and 35 kDa proteins peaked immediately prior to deacclimation; the 41 and 48 kDa proteins peaked during maximum hardiness and decreased towards deacclimation, while the 90 kDa plateaued during the same period. Maximum hardiness and relative dehydrin band intensity were positively correlated ( p < 0.050) for all but the 23 kDa protein. The variation in accumulation patterns and relationships to cold hardiness indicates that these dehydrin proteins are likely regulated by different molecular processes and could play different roles in cryoprotection throughout dormancy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,818
Score d'incertitude au seuil0,621

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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