One piece of the puzzle: Modeling vector presence and environment reveals seasonality, distribution, and prevalence of sandflies and Leishmania in an expansion area
Notice bibliographique
Résumé
The recent geographic spread of Leishmania infantum along the borders of Argentina, Brazil and Paraguay has been highlighted. In our previous study, Lutzomyia longipalpis was found in 55 of 123 patches surveyed, and in some patches, sandflies were found at higher densities, forming hotspots. Based on the One Health approach, we investigated the seasonality of the vector, the presence of parasite DNA, and the environmental factors that contribute to vector and parasite dispersal in these previously described hotspots in Foz do Iguaçu, Brazil. Entomological surveys were conducted monthly for one year. Fourteen hotspots peridomicile and six intradomicile were sampled. PCR was used to assess the prevalence of Leishmania DNA in sandflies. Zero-inflated negative binomial regression was used to determine the association of micro- and mesoscale environmental variables with the occurrence and abundance of the three most abundant sandfly species sampled. A total of 3543 species were captured, with Lutzomyia longipalpis being the predominant species (71.78%) of the 13 species found. Evandromyia edwardsi, Expapillata firmatoi, Micropygomyia ferreirana and Pintomyia christenseni were reported for the first time in the region. NDVI, distance to water, precipitation, west-to-east wind, wind speed, maximum and minimum relative humidity, and sex were significant variables associated with vector presence/abundance in the environment. Vector presence/abundance in the peridomicile was associated with precipitation, altitude, maximum temperature, minimum and maximum relative humidity, west-to-east wind, wind speed, and sex. Leishmania DNA was detected in an average of 21% of Lu. longipalpis throughout the year. Vector abundance is concentrated in urban and peri-urban areas, with some specimens present in different parts of the city and some sites with high vector abundance. This distribution suggests that the risk of actual contact between humans and parasite vectors in urban areas during the epidemic period is associated with patches of peri-urban vegetation and then extends into urban areas.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».