Genetic Diversity of Listeria Detected in the Production Environment of Meat Processing
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The safety of food production as concerns Listeria is the key to the sanitary wellbeing of manufactured products. Molecular-genetic methods for the analysis of Listeria, including whole-genome sequencing, are effective in monitoring persistent contaminants and in the epidemic investigation of cases of foodborne infections. They have been adopted in the European Union, United States, and Canada. In Russia, multilocus and whole-genome sequencing has proven itself in the analysis of clinical food isolates and Listeria from the environment. The objective of the study was molecular-genetic characterization of Listeria detected in the industrial environment of meat processing. To characterize the Listeria isolates, microbiological methods were used according to GOST (State Standard) 32031–2012, as well as multilocus sequencing, including the analysis of seven housekeeping genes and four virulence genes, as well as whole-genome sequencing. In swabs that were positive for the presence of Listeria spp. taken at two meat-processing plants in Moscow, Listeria monocytogenes constituted 81% and L. welshimeri 19%. The predominant genotype (Sequence Type, ST) of L. monocytogenes was ST8. The variety was supplemented with ST321, ST121, and ST2330 (CC9 (Clonal Complex 9)). L. welshimeri, which prevailed in the second production, was represented by ST1050 and ST2331. The genomic characteristics of L. welshimeri isolates confirmed that they have high adaptive capabilities both as concerns production conditions (including resistance to disinfectants) and the metabolic peculiarities of the gastrointestinal tract of animals. L. monocytogenes CC9 and CC121 are also correlated with food production in other countries. However, L. monocytogenes CC8 and CC321 can cause invasive listeriosis. The concordance in the internalin profile of the ST8 isolates from the industrial environment with the clinical isolates ST8 and ST2096 (CC8) is a cause for concern. The study showed the effectiveness of molecular-genetic methods in determining the diversity of Listeria detected in the production environment of meat processing, and laid the foundation for monitoring of persistent contaminants.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».