MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4380244217 · doi:10.1101/2023.06.09.544407

<sup>13</sup> C metabolite tracing reveals glutamine and acetate as critical in vivo fuels for CD8 <sup>+</sup> T cells

2023· preprint· en· W4380244217 sur OpenAlexaff
H. Eric, Michael S. Dahabieh, Lisa M. DeCamp, Irem Kaymak, Susan M. Kitchen-Goosen, Dominic G. Roy, Mark Verway, Radia Marie Johnson, Bożena Samborska, Catherine Scullion, Mya Steadman, Matthew Vos, Thomas P. Roddy, Connie M. Krawczyk, Kelsey S. Williams, Ryan D. Sheldon, Russell G. Jones

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesAgios Pharmaceuticals
Mots-clésGlutamineIn vivoCitric acid cycleBiologyEffectorMetabolic pathwayMetabolismBiochemistryCD8MetaboliteChemistryImmune systemCell biologyAmino acidImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Infusion of 13C-labeled metabolites provides a gold-standard for understanding the metabolic processes used by T cells during immune responses in vivo . Through infusion of 13C-labeled metabolites (glucose, glutamine, acetate) in Listeria monocytogenes ( Lm )-infected mice, we demonstrate that CD8+ T effector (Teff) cells utilize metabolites for specific pathways during specific phases of activation. Highly proliferative early Teff cells in vivo shunt glucose primarily towards nucleotide synthesis and leverage glutamine anaplerosis in the tricarboxylic acid (TCA) cycle to support ATP and de novo pyrimidine synthesis. Additionally, early Teff cells rely on glutamic-oxaloacetic transaminase 1 (Got1)—which regulates de novo aspartate synthesis—for effector cell expansion in vivo . Importantly, Teff cells change fuel preference over the course of infection, switching from glutamine-to acetate-dependent TCA cycle metabolism late in infection. This study provides insights into the dynamics of Teff metabolism, illuminating distinct pathways of fuel consumption associated with Teff cell function in vivo . Teaser Interrogating dynamics of fuel utilization by CD8 + T cells in vivo reveals new metabolic checkpoints for immune function in vivo .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetImmune Cell Function and Interaction→Travaux en français237 207→