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Enregistrement W4380372553 · doi:10.1093/neuonc/noad073.176

HGG-27. THE IMPACT OF MISMATCH REPAIR DEFICIENCY ON GLIOMAS IN CHILDREN, ADOLESCENTS, AND YOUNG ADULTS; A REPORT FROM THE IRRDC AND THE GLIOMA TASK FORCE

2023· article· en· W4380372553 sur OpenAlexaffabout
Logine Negm, Liana Nobre, Julie Bennett, Jiil Chung, Martin Komosa, Nick Fernandez, Michelle Ku, Monique Johnson, Vanessa Bianchi, Melyssa Aronson, Cindy Zhang, Lucie Stengs, Mary Jane Lim-Fat, Julia Keith, Derek S. Tsang, Andrew Gao, David G. Muñoz, Lananh Nguyen, Sunit Das, Adrian Levine, Anirban Das, Adam Resnick, David A. Wheeler, Cynthia Hawkins, Uri Tabori

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of TorontoMount Sinai HospitalHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science CentreStructural Genomics ConsortiumHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineGermlineOncologyGliomaDNA mismatch repairInternal medicineCancer researchGermline mutationCancerMutationGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mismatch repair deficiency (MMRD) is a pan-cancer mechanism resulting in universal hypermutation. MMRD-gliomas are resistant to chemoradiation but respond to immunotherapy. MMRD can occur somatically or be inherited as part of Lynch Syndrome (LS) or Constitutional Mismatch Repair Deficiency (CMMRD). However, the prevalence of MMRD in gliomas of children, adolescents, and young adults (CAYA), and impact of germline inheritance is unknown. We utilized functional genomic tools on population-based and validation cohorts from 3 large databases (Toronto, St-Jude and CBTN) to determine the prevalence, subgroup, and impact of germline mutations on MMRD-gliomas. Ongoing data on 998 pediatric-gliomas from Toronto reveals that MMRD is extremely rare in pediatric low-grade gliomas (PLGG) but common in pediatric high-grade gliomas (PHGG) (9%, p<0.0001). Similarly, data from St-Jude and CBTN (n=374) reveals that MMRD exists only in PHGG (8%). In both cohorts, MMRD-PHGG are enriched for RAS/MAPK, IDH, and TP53 mutations while pediatric-type fusions, BRAF-V600E and histone mutations are absent. In AYA-HGG (n=884), the most common groups include glioblastomas without chromosome-7/10 alterations (9%) and IDH1-astrocytomas, while MMRD is not present in IDH-oligodendrogliomas. All but 1 CAYA-MMRD-gliomas harbored germline MMR mutations. Data from the IRRDC on 174 patients reveal that LS is more common than CMMRD in gliomas, with the median age of onset 11 and 29 years in CMMRD and LS, respectively (p<0.001). Furthermore, CMMRD gliomas are commonly caused by germline PMS2 and MSH6 mutations, enriched for secondary polymerase mutations (60%, p<0.001), and exhibit ultra-hypermutation. In contrast, LS-gliomas are caused by MSH2 and MLH1 mutations, and enriched for IDH1 mutations (32%, p<0.025) with a lower mutational burden. Our data reveals high prevalence of MMRD in CAYA-HGG with alarming impact of germline predisposition. Specifically, unrecognized LS patients with AYA MMRD-HGG. These findings support universal screening for MMRD in HGG to identify patients for immunotherapy and surveillance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,448

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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