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Enregistrement W4380488503 · doi:10.1101/2023.06.12.543244

Improved short-channel regression for mapping resting-state functional connectivity networks using functional near-infrared spectroscopy

2023· preprint· en· W4380488503 sur OpenAlexaff
Sergio L. Novi, Androu Abdalmalak, Karnig Kazazian, Loretta Norton, Derek Debicki, Rickson C. Mesquita, Adrian M. Owen

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOptical Imaging and Spectroscopy Techniques
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésResting state fMRICommunication noiseComputer scienceChannel (broadcasting)RegressionFunctional connectivitySoftware portabilityFunctional near-infrared spectroscopyLinear regressionNeuroscienceArtificial intelligenceMachine learningPsychologyMathematicsStatisticsTelecommunicationsCognition

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Resting-state functional connectivity (rsFC) is an attractive biomarker of brain function that can vary with brain injury. The simplicity of resting-state protocols coupled with the main features of functional near-infrared spectroscopy (fNIRS), such as portability and versatility, can facilitate the monitoring of unresponsive patients in acute settings at the bedside. However, accurately mapping rsFC networks is challenging due to signal contamination from non-neural components, such as scalp hemodynamics and systemic physiology. Physiological noise may be mitigated through the use of short channels which may be able to provide sufficient information to eliminate the need for additional measurement devices, decreasing the complexity of the experimental setup. To this end, we examined the extent to which systemic physiology is embedded in the short-channel data and improved short-channel regression to account for temporal heterogeneity in the scalp hemodynamics. Our findings indicate that using temporal shifts in the short-channel data increases the agreement, by 70% on average, between short-channel regression and regression that includes short channels and physiological recordings. Overall, this method decreases the need for additional physiological recordings when mapping rsFC networks, providing a viable alternative when such measurements are not available or feasible.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,723
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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