#2561 URINE PROTEOMICS FOR PREDICTION OF DISEASE PROGRESSION IN PATIENTS WITH IGA NEPHROPATHY
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background and Aims IgA nephropathy (IgAN) may lead to kidney failure. The urinary proteomics biomarker-based classifier (IgAN237) may predict progression at the time of kidney biopsy [1]. We now studied whether IgAN237 predicts disease progression not only at the time of biopsy but also later in the course of IgAN. Method Urine samples from 103 patients with biopsy-proven IgAN were analyzed using capillary electrophoresis-mass spectrometry at baseline (IgAN237 score-1) and 89 also at follow-up (IgAN237 score-2). Patients were grouped into ‘non-progressors’ (IgAN237 score ≤0.38 Units) and ‘progressors’ (IgAN237 score >0.38 Units). Historical and follow-up data included, e.g., estimated glomerular filtration rate (eGFR)-slopes, urinary albumin/creatinine ratio (UACR)-slopes and medication. Multiple logistic regression analysis, using a stepwise model, was done with progressors and non-progressors as dependent factors including explanatory variables age, sex, eGFR- and UACR-slopes. Results Median age at biopsy was 44 years (range 11-92); 63% were male. Median interval between biopsy and IgAN237 score-1 was 65 months (0-606), and between IgAN237 score-1 and score-2 was 258 days (71-531). IgAN237 score-1 and score-2 values did not differ significantly and were correlated (rho = 0.44, p<0.001). Twenty-eight and 26% of patients were classified as progressors based on IgAN237 score-1 and score-2, respectively. The IgAN237 score inversely correlated with the chronic eGFR slopes (rho = -0.278, p = 0.02 for score-1; rho = -0.409, p = 0.002 for score-2) and with ±180days eGFR slopes (rho = -0.31, p = 0.009 and rho = -0.439, p = 0.001, respectively) (Figure 1). The ±180days eGFR-slopes were more reduced for progressors than non-progressors (median -5.98 versus -1.22 mL/min/1.73m2 per year for score-1, p<0.001; -3.02 vs 1.08 mL/min/1.73m2 per year for score-2, p = 0.047) (Figure 2). The only significant variable maintained in a multiple logistic regression analysis for IgAN237 score-1 (progressor vs non-progressor) was ±180days eGFR slope (p<0.001) and for IgAN237 score-2 the UACR (p = 0.002) and age at baseline (p = 0.016). Conclusion The urinary IgAN237 classifier represents a risk stratification tool in IgAN not only at the time of biopsy but also later in the course of the disease. It may guide physicians in management and follow-up strategies in an individualized manner.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».