Editorial: Insights in epigenomics and epigenetics: 2022
Notice bibliographique
Résumé
The top-most viewed original research paper in this "Insights" Research Topic was by Wang and colleagues and was titled "Genetic regulation of newborn telomere length is mediated and modified by DNA methylation" (Wang et al.).This paper came out in October, 2022, and already has over 1,167 views at the time this editorial was written, according to the Frontiers Media site "Loop Research Network" which maps "views," "downloads," "citations," "social buzz," and "demographics" (https://loop.frontiersin.org/).This research paper studied 281 mom-newborn pairs from the ENVIRonmental influence ON early AGEing (ENVIRONAGE) pregnancy cohort comparing DNA 5 mC methylation and telomere (TEL) lengths on genomic DNA isolated from the blood of the mother with that from the babies' umbilical cord.This paper was a tour-de-force of high-dimensional omics analyses.The second-most viewed original research paper was by Lothion-Roy and colleagues and is titled, "Clinical and molecular significance of the RNA m6A methyltransferase complex in prostate cancer" (Lothion-Roy et al.).This paper came out in January, 2023, and already has 1,096 views.N6-methyl adenine (m6A) is the most abundant internal mRNA modification in eukaryotes and regulates processes such as mRNA translation into protein, mRNA alternative splicing, and mRNA stability.The authors studied the levels of key proteins in the m6A pathway in prostate cancer cells and cell lines.Prostate cancer is the most abundant non-cutaneous cancer in men and the authors wanted to determine whether any of the m6A proteins correlate with the type of prostate cancer or the severity and prognosis of the disease.Overall, this is an exciting paper which points to m6A biology as a new avenue for prostate cancer research.The third-most viewed original research paper was by Thumfart and colleagues and was titled "Long-term effects of early postnatal stress on Sertoli cells" (Thumfart et al.).This paper also came out in October, 2022, and has 877 views in this short period of time.This paper studied Sertoli cells from adult male mice, which are tightly associated with germ cells, provide structural support for differentiating sperm, and help form a tight blood-testis barrier.The Sertoli cells are highly glycolytic because they need to provide high levels of lactate to the differentiating sperm as an energy source.The stress applied to the moms and
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,016 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,004 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,002 |
| Communication savante | 0,006 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,010 | 0,012 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,041 | 0,025 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».