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Enregistrement W4380677045 · doi:10.3899/jrheum.2022-1321

Association Between HLA Alleles and Autoantibodies in Dermatomyositis Defined by Sarcoplasmic Expression of Myxovirus Resistance Protein A

2023· article· en· W4380677045 sur OpenAlexvenueno aff
Munenori Oyama, Yuko Ohnuki, Akinori Uruha, Yoshihiko Saito, Yukako Nishimori, Michio Inoue, Jantima Tanboon, Naoko Okiyama, Takashi Shiina, Ichizo Nishino, Shigeaki Suzuki

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInflammatory Myopathies and Dermatomyositis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutoantibodyMedicineDermatomyositisAlleleImmunologyInternal medicineOdds ratioPolymyositisGenotypingHuman leukocyte antigenGastroenterologyAntibodyGenotypeGeneticsAntigenBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective The diagnosis in the studies analyzing HLA of dermatomyositis (DM) was based on a combined clinical category of polymyositis/DM. This retrospective study investigated the associations of HLA with 5 DM-specific autoantibodies in Japanese patients diagnosed by muscle pathology. Methods We diagnosed Japanese patients with DM based on sarcoplasmic expression of myxovirus resistance protein A. These patients underwent investigation for 5 DM-specific autoantibodies and HLA genotyping. Results Of 175 patients (83 males and 92 females; range 1-86 yrs; mean 46 yrs), 173 (98.9%) had 1 of the 5 autoantibodies. Seven alleles— A*02:07, B*46:01, DRB1*04:07, DRB1*07:01, DRB1*08:03, DQB1*06:01 , and DPB1*02:02 —were more frequently detected in the patients with DM than healthy controls, but these associations were not significant after multiple testing correction. Stratifying by DM-specific autoantibodies, we found the associations of 6 already known and 7 new alleles— B*48:01, B*52:01, C*12:02, DRB1*04:05, DRB1*15:02, DPB1*05:01 , and DPB1*09:01 —with subsets of DM. Moreover, significant associations of 5 alleles with antinucleosome remodeling deacetylase complex (Mi-2) remained after multiple testing correction. In particular, the DRB1*04:07 (odds ratio [OR 28.9]; corrected P = 2.7 × 10 −6 ) and DQB1*06:01 (OR 4.0; corrected P = 1.6 × 10 −4 ) alleles were significantly more prevalent in patients with anti-Mi-2 antibody than in controls. Conclusion This study demonstrates DM-specific autoantibodies defined immunogenetic subsets of DM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,143
Score d'incertitude au seuil0,362

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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