Abstract 15564: Transcriptional Profiling Unveils New Molecular Subgroups of Adaptive and Maladaptive Right Ventricular Remodeling in Pulmonary Hypertension
Notice bibliographique
Résumé
The right ventricle (RV) function plays a crucial role in the prognosis and functional outcome of PAH (Pulmonary Arterial Hypertension) patients. However, RV remodeling and its underlying mechanisms in PAH, and the molecular phenotype of RV in different disease conditions are poorly understood. Therefore, we designed this study to deeply investigate molecular changes underlying right ventricular remodeling and dysfunction in PAH. To this aim, we generated RNA-seq data from 40 patients' RV tissues, clinically classified in adaptive versus maladaptive RV hypertrophy. Using an unsupervised clustering-based analysis, we identified “early” and “late” subgroups in both diseased RV states, associated with patients’ hemodynamic profiles. We then demonstrated that the compensated RV is characterized by an upregulation of cell cycle-associated genes and mitochondrial respiration, whereas excessive levels of extracellular matrix components were central in the decompensation phase. However, dysregulation of fatty acid β-oxidation characterized the early decompensation phase. Furthermore, a comparative analysis from 30 RV samples of monocrotaline (MCT)-induced rat model largely confirmed the stage-specific molecular phenotypes, along with subgroups identification. Finally, we assessed the circulating levels of several dysregulated proteins in two independent cohorts of PAH patients and introduced a panel of five ECM-related proteins that had a significant alteration in patients with compensated vs. decompensated RV in both cohorts. Among those, NID1, C1QTNF1, and CRTAC1 demonstrated higher importance in predicting the development of maladaptive RV hypertrophy in both cohorts, while the correlation of their expression with cardiac functions confirmed their potential biomarker capacity in the prognosis of PAH-associated RV hypertrophy and failure. In conclusion, this comprehensive transcriptome study revealed new subgroups of human RV hypertrophy beyond the clinical measurements, while combination with proteome analysis proposed a panel of potential PAH biomarkers related to patients' RV function. Furthermore, our comparative analysis of two species supports the relevance of current animal models to explore new targets.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».