Spatially varying catchability for integrating research survey data with other data sources: case studies involving observer samples, industry-cooperative surveys, and predators as samplers
Notice bibliographique
Résumé
Spatio-temporal models are widely applied to standardise research survey data and are increasingly used to generate density maps and indices from other data sources. We developed a spatio-temporal modelling framework that integrates research survey data (treated as a “reference dataset”) and other data sources (“non-reference datasets”) while estimating spatially varying catchability for the non-reference datasets. We demonstrated it using two case studies. The first involved bottom trawl survey and observer data for spiny dogfish ( Squalus acanthias) on the Chatham Rise, New Zealand. The second involved cod predators as samplers of juvenile snow crab ( Chionoecetes opilio) abundance, integrated with industry-cooperative surveys and a bottom trawl research survey in the eastern Bering Sea. Our integrated models leveraged the strengths of individual data sources (the quality of the reference dataset and the quantity of non-reference data), while downweighting the influence of the non-reference datasets via the estimated spatially varying catchabilities. They allowed for the generation of annual density maps for a longer time-period and for the provision of one single index rather than multiple indices each covering a shorter time-period.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,047 | 0,079 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,004 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,003 |
| Communication savante | 0,003 | 0,006 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,005 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».