Abstract 13821: Genetic Identification of Homozygous Familial Hypercholesterolemia by Long-Read Sequencing Among Patients With Clinically Diagnosed Heterozygous Familial Hypercholesterolemia
Notice bibliographique
Résumé
Background: Homozygous Familial Hypercholesterolemia (HoFH) is a rare genetic disorder characterized by extremely elevated plasma low-density lipoprotein cholesterol (LDL-C) and accelerated atherosclerosis. Accurate identification of patients with HoFH is essential as they may be eligible for specialized treatments. The objective of this study was to identify and characterize patients with HoFH among patients with clinically diagnosed heterozygous FH (HeFH). Methods: We studied patients from the British Columbia FH Registry with a Dutch Lipid Clinic Network score ≥6 and no secondary cause of hypercholesterolemia. We performed targeted next-generation sequencing of the LDLR , APOB , PCSK9 and LDLRAP1 genes. Long-read sequencing of the LDLR gene was subsequently done for patients with >1 pathogenic LDLR variant to determine haplotypes. We examined lipid levels and cardiovascular events (unstable angina, myocardial infarction and coronary revascularization). Results: Among 705 patients with clinically diagnosed HeFH, we identified a single pathogenic variant in 300 (42.6%) patients and >1 pathogenic variant in the LDLR gene in 11 (1.6%) patients. We established a genetic diagnosis of HoFH in 6 (0.9%) patients (3 true homozygous and 3 compound heterozygous in trans). The mean baseline LDL-C of genetically identified HoFH patients was significantly higher than those with 1 variant. The prevalence of premature cardiovascular disease was numerically greater in the genetically identified HoFH group (29.4% vs 18.0%, p=0.2). Conclusions: In a cohort of patients with clinically diagnosed HeFH, genetic testing by long-read sequencing revealed that 0.9% had HoFH. These patients tended to have a more severe phenotype. Genetic testing of patients with clinical FH may identify patients with HoFH that had eluded clinical diagnosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».