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Enregistrement W4380793879 · doi:10.1161/circ.146.suppl_1.12681

Abstract 12681: GWAS Meta-Analysis in SCAD, a Women Predominant Ischemic Heart Disease, Reveals Common Variants and Genes Related to Artery Integrity and Tissue-Mediated Coagulation

2022· article· en· W4380793879 sur OpenAlexaff
David Adlam, Takiy-Eddine Berrandou, Adrien Georges, Christopher P. Nelson, Eleni Giannoulatou, Lijiang Ma, Montgomory Blencowe, Tamiel N. Turley, Min‐Lee Yang, Siiri E. Iismaa, Ingrid Tarr, David W.M. Muller, Stephanie Hesselson, Keerat Junday, Diane Fatkin, Nicolas Combaret, Jacqueline Saw, Tom R. Webb, Marysia S. Tweet, Sharonne N. Hayes, Yang Xia, Santhi K. Ganesh, Timothy M. Olson, Jason C. Kovacic, Robert M. Graham, Nilesh J. Samani, Nabila Bouatia‐Naji

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiovascular Issues in Pregnancy
Établissements canadiensVancouver General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésScadMedicineGenome-wide association studyCoronary artery diseaseMyocardial infarctionInternal medicineCardiologySingle-nucleotide polymorphismSNPGeneticsBioinformaticsGeneBiologyGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Spontaneous coronary artery dissection (SCAD) is an understudied cause of acute myocardial infarction due to hematoma formation in coronary arteries primarily affecting women. It is not known to what extent SCAD is genetically distinct from other cardiovascular diseases, including atherosclerotic coronary artery disease (CAD). Methods and Results: Through a meta-analysis of 8 GWAS (1917 cases, 9292 controls of European ancestry), we identified 17 risk loci, including 12 new. Functional annotations pointed at enrichment in enhancer marks of arteries, specifically smooth muscle cells, and strong candidate genes, such as tissue factor gene ( F3 ) on Chr1 near rs1146473 (OR=1.32, P=5.8 х10 -9 ). F3 is novel for SCAD or any cardiovascular disease. The risk allele correlated with F3 lower expression in arteries, supporting a mechanism consistent with hematoma formation. Bayesian gene regulatory networks constructed from expression and genetics data indicated the extracellular matrix organization in arteries as the biological function where most prioritized genes clustered (e.g. COL4A1/A2, HTRA1, and TIMP3 ). Overall, we report substantial polygenicity for SCAD (LDSC: h 2 SNP = 0.71 ± 0.11) and shared genetics with several neurovascular diseases (e.g intracranial aneurysm). Intriguingly, for 6 loci, colocalization analyses showed that SCAD and CAD are likely to share the same causal variants but involve opposite risk alleles (e.g COL4A1/A2 ). In addition, a negative genetic correlation was found between SCAD and CAD (rg=-0.12; P=3.7х10 -3 ), including after conditioning on BP (mt-COJO: rg CAD/SBP =-0.19, P=4.6х10 -6 ). Mendelian randomization analyses indicated higher BP to associate with increased risk for SCAD (beta IVW-SBP =0.05, P=7.6х10 -6 , beta IVW-DBP =0.10, P=1.9х10 -6 ) and CAD (beta IVW-SBP =0.04, P=8.6х10 -49 ; DBP: beta IVW-DBP =0.06, P=1.6х10 -44 ) but not BMI, lipids, or type 2 diabetes, which we confirmed as genetic risk factors for CAD Conclusions: Our results set the stage for future investigation of novel biological pathways relevant to both SCAD and CAD and potential therapeutic and preventive strategies specifically targeting this ischemic disease predominantly affecting women.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,008
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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Résumé présentoui

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