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Enregistrement W4380881042 · doi:10.1101/2023.06.13.23290941

Loss-of-function variants in <i>CUL3</i> cause a syndromic neurodevelopmental disorder

2023· preprint· en· W4380881042 sur OpenAlexaff
Patrick R. Blackburn, Frédéric Ebstein, Tzung‐Chien Hsieh, Marialetizia Motta, Francesca Clementina Radio, Johanna C. Herkert, Tuula Rinne, Isabelle Thiffault, Michele Rapp, Mariel Alders, Saskia M. Maas, Bénédicte Gérard, Thomas Smol, Catherine Vincent‐Delorme, Benjamin Cogné, Bertrand Isidor, Marie Vincent, Ruxandra Bachmann‐Gagescu, Anita Rauch, Pascal Joset, Giovanni Battista Ferrero, Andrea Ciolfi, Thomas Husson, Anne‐Marie Guerrot, Carlos A. Bacino, Colleen Macmurdo, Stephanie S. Thompson, Jill A. Rosenfeld, Laurence Faivre, Frédéric Tran Mau‐Them, Wallid Deb, Virginie Vignard, Pankaj B. Agrawal, Jill A. Madden, Alice Goldenberg, François Lecoquierre, Michael Zech, Holger Prokisch, Ján Necpál, Robert Jech, Juliane Winkelmann, Monika Turčanová Koprušáková, Vassiliki Konstantopoulou, John R. Younce, Marwan Shinawi, Chloe Mighton, Charlotte Fung, Chantal F. Morel, Jordan Lerner‐Ellis, Stephanie DiTroia, Magalie Barth, Dominique Bonneau, Ingrid P.C. Krapels, Vyne van der Schoot, Theresa Brunet, Cornelia Bußmann, Cyril Mignot, Thomas Courtin, Claudia Ravelli, Boris Keren, Alban Ziegler, Linda Hasadsri, Pavel N. Pichurin, Eric W. Klee, Katheryn Grand, Pedro A. Sanchez‐Lara, Elke Krüger, Stéphane Bezieau, Hannah Klinkhammer, Peter Krawitz, Evan E. Eichler, Marco Tartaglia, Sébastien Küry, Tianyun Wang

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalSinai Health SystemUniversity Health NetworkUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeurodevelopmental disorderLoss functionMedicineGeneticsBiologyPhenotypePsychiatryAutismGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Purpose De novo variants in CUL3 (Cullin-3 ubiquitin ligase) have been strongly associated with neurodevelopmental disorders (NDDs), but no large case series have been reported so far. Here we aimed to collect sporadic cases carrying rare variants in CUL3, describe the genotype-phenotype correlation, and investigate the underlying pathogenic mechanism. Methods Genetic data and detailed clinical records were collected via multi-center collaboration. Dysmorphic facial features were analyzed using GestaltMatcher. Variant effects on CUL3 protein stability were assessed using patient-derived T-cells. Results We assembled a cohort of 35 individuals with heterozygous CUL3 variants presenting a syndromic NDD characterized by intellectual disability with or without autistic features. Of these, 33 have loss-of-function (LoF) and two have missense variants. CUL3 LoF variants in patients may affect protein stability leading to perturbations in protein homeostasis, as evidenced by decreased ubiquitin-protein conjugates in vitro . Specifically, we show that cyclin E1 (CCNE1) and 4E-BP1 (EIF4EBP1), two prominent substrates of CUL3, fail to be targeted for proteasomal degradation in patient-derived cells. Conclusion Our study further refines the clinical and mutational spectrum of CUL3 -associated NDDs, expands the spectrum of cullin RING E3 ligase-associated neuropsychiatric disorders, and suggests haploinsufficiency via LoF variants is the predominant pathogenic mechanism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,337
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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