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Enregistrement W4380882471 · doi:10.3389/fpls.2023.1227424

Editorial: Advances in metabolism and chemodiversity - focus - plant enzymes

2023· editorial· en· W4380882471 sur OpenAlexaff
Zhi‐Yan Du, Yang Qu, Zhenhua Liu, Mariam Gaid

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2023
Typeeditorial
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme Catalysis and Immobilization
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesNational Science Foundation
Mots-clésPlant metabolismFocus (optics)EnzymeBiologyComputational biologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Advances in metabolism and chemodiversity -focus -plant enzymes Plant enzymes are indispensable for plant metabolism and are critical determinants of the extensive chemodiversity observed in plants.These enzymes serve as primary catalysts in biosynthetic pathways, enabling the biosynthesis of a diverse range of secondary metabolites, such as alkaloids, terpenes, and phenolics.These metabolites are essential for the distinctive sensory qualities of plants, e.g., flavors, scents, and colors, and they also possess significant biological activities with promising applications in agriculture, medicine, and industry.Recent scientific investigations have been devoted to unraveling the intricate biochemistry of enzymes in photosynthetic organisms, elucidating their catalytic mechanisms, regulatory processes, and evolutionary trajectories.For instance, recent researches have elucidated dynamic diversifying mechanisms underlying the synthesis of phenolic acid in Salvia miltiorrhiza (Zhou et al., 2021), alkaloids in Catharanthus roseus (Eng et al., 2022), triterpenes in Eriobotrya japonica (Su et al., 2021), and xanthones in Hypericum species (Singh et al., 2020;Singh et al., 2021).These studies have yielded valuable insights into the biosynthetic pathways of pivotal compounds in non-model plants.By augmenting the understanding of plant enzyme biochemistry, scientists can harness their immense potential for advancing sustainable agriculture, facilitating drug discovery, and fostering the development of plant-based products, thereby endrosing positive impacts on human health and the environment.This Research Topic includes six original research articles, with a special focus on the function of plant enzymes.Zhang et al. reported that Prunus mume cinnamyl alcohol dehydrogenase 1 and 2 (PmCAD1 and 2) are the major contributors to the cinnamyl alcohol biosynthesis and emission, which was identified after analysing the endogenous volatile compounds and the transcriptomes gleaned from six P. mume cultivars (Figure 1A).Another research on floral fragrant components in Rosa rugosa revealed 156 differential volatile organic compounds, from two metabolic pathways: the monoterpenoid biosynthetic pathway and the amino acid (phenylalanine, tyrosine, and Frontiers in Plant Science frontiersin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: Éditorial
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,131

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0060,004
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0090,010
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0390,025

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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