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Enregistrement W4380886788 · doi:10.1016/j.xhgg.2023.100213

Variants in ACTC1 underlie distal arthrogryposis accompanied by congenital heart defects

2023· article· en· W4380886788 sur OpenAlexaff
Jessica X. Chong, Matthew C. Childers, Colby T. Marvin, Anthony J. Marcello, Hernán Gonorazky, Lili‐Naz Hazrati, James J. Dowling, Fatema Al Amrani, Yasemin Alanay, Yolanda Ber, Miguel Ángel Marín Gabriel, Arthur S. Aylsworth, Kati J. Buckingham, Kathryn M. Shively, Olivia Sommers, Kailyn Anderson, Michael Regnier, Michael J. Bamshad

Notice bibliographique

RevueHuman Genetics and Genomics Advances · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute of General Medical SciencesNational Human Genome Research InstituteNational Institutes of HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteUniversity of Washington
Mots-clésMYH7SarcomereSkeletal muscleActinBiologyCardiac muscleMyosinCardiomyopathyTropomyosinMissense mutationMYH6MyocyteArthrogryposisGeneticsInternal medicineGeneAnatomyMedicineCell biologyPhenotypeHeart failureMyosin light-chain kinase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Contraction of the human sarcomere is the result of interactions between myosin cross-bridges and actin filaments. Pathogenic variants in genes such as MYH7, TPM1, and TNNI3 that encode parts of the cardiac sarcomere cause muscle diseases that affect the heart, such as dilated cardiomyopathy and hypertrophic cardiomyopathy. In contrast, pathogenic variants in homologous genes MYH2, TPM2, and TNNI2, that encode parts of the skeletal muscle sarcomere, cause muscle diseases affecting skeletal muscle, such as the distal arthrogryposis (DA) syndromes and skeletal myopathies. To date, there have been few reports of genes (e.g., MYH7) encoding sarcomeric proteins in which the same pathogenic variant affects both skeletal and cardiac muscle. Moreover, none of the known genes underlying DA have been found to contain pathogenic variants that also cause cardiac abnormalities. We report five families with DA due to heterozygous missense variants in the gene actin, alpha, cardiac muscle 1 (ACTC1). ACTC1 encodes a highly conserved actin that binds to myosin in both cardiac and skeletal muscle. Pathogenic variants in ACTC1 have previously been found to underlie atrial septal defect, dilated cardiomyopathy, hypertrophic cardiomyopathy, and left ventricular noncompaction. Our discovery delineates a new DA condition due to variants in ACTC1 and suggests that some functions of actin, alpha, cardiac muscle 1 are shared in cardiac and skeletal muscle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,378
Score d'incertitude au seuil0,680

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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