Immune profiling after allogeneic hematopoietic cell transplantation in pediatric acute myeloid leukemia
Notice bibliographique
Résumé
Although allogeneic hematopoietic cell transplant (allo-HCT) is curative for high-risk pediatric acute myeloid leukemia (AML), disease relapse remains the primary cause of posttransplant mortality. To identify pressures imposed by allo-HCT on AML cells that escape the graft-versus-leukemia effect, we evaluated immune signatures at diagnosis and posttransplant relapse in bone marrow samples from 4 pediatric patients using a multimodal single-cell proteogenomic approach. Downregulation of major histocompatibility complex class II expression was most profound in progenitor-like blasts and accompanied by correlative changes in transcriptional regulation. Dysfunction of activated natural killer cells and CD8+ T-cell subsets at relapse was evidenced by the loss of response to interferon gamma, tumor necrosis factor α signaling via NF-κB, and interleukin-2/STAT5 signaling. Clonotype analysis of posttransplant relapse samples revealed an expansion of dysfunctional T cells and enrichment of T-regulatory and T-helper cells. Using novel computational methods, our results illustrate a diverse immune-related transcriptional signature in posttransplant relapses not previously reported in pediatric AML.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».