Abundance, geo-microbial role and community diversity of sulfate-reducing bacteria in tropical estuarine sediments
Notice bibliographique
Résumé
Sulfate-reducing bacteria (SRB), a diverse taxonomic group of anaerobic microorganisms that oxidize sulfur compounds as terminal electron acceptors, drive the key biogeochemical process of sulfate reduction. However, little is known about the diversity of SRB in tropical coastal habitats. Thus, the goal of this study is to explore and compare the community diversity of the Ashtamudi and Vembanad estuaries and evaluate the sedimentary sulfate reduction rate. The microbiome profiling of SRB was carried out using Next Generation Sequencing (NGS) techniques (Illumina sequencing) based on gene amplification of the dissimilatory sulfate reductase (dsr) enzyme to confirm the diversity and dominant taxa of SRB. The diversity of SRB represented by the Shannon alpha diversity index of the Ashtamudi estuary (6.55) was two-fold that of the Vembanad estuary. In the Vembanad estuary, the marine zone (4.09) harboured more diversity than the freshwater zone (1.825). Higher diversity and lower abundant taxa in the Ashtamudi estuary pointed out the presence of a rare biosphere that has not yet been studied. It was interesting to note that both estuaries have the same SRB phylum diversity. At the level of species, however, there was a noticeable difference. This differential diversity of SRB has an apparent influence on methane production during the breakdown of organic matter in addition to sulfate reduction. Several species of SRB have an important role in the biodegradation of persistent pollutants and the removal of heavy metals.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».