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Enregistrement W4380990448 · doi:10.15789/1563-0625-pco-2839

Phenotype characteristic of colonic intraepithelial lymphocytes in patients with Crohn's disease

2023· article· en· W4380990448 sur OpenAlexaboutno aff
D. B. Nizheharodava, Anatoli Shuleika, A. M. Starastsin, M. I. Vanslau, G. I. Ivanchyk, Alesia V. Vialichka, M. М. Zafranskayа

Notice bibliographique

RevueMedical Immunology (Russia) · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIntraepithelial lymphocyteImmune systemImmunologyPathogenesisCrohn's diseaseFlow cytometryAntigenPhenotypeIntestinal mucosaCD3Monoclonal antibodyBiologyAntibodyMedicineDiseasePathologyCD8Internal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Intraepithelial lymphocytes (IEL) play a critical role in maintaining the immune balance of the gut and provide the first line of mucosal defense against luminal antigens as well as rapidly respond to epithelial injury. Recently, IEL have received a lot of attention as key mediators of aberrant immune response resulted in persistent immune activation, inflammation and altered intestinal barrier function, seen in Crohn's disease (CD). This study describes for the first time subsets of colonic IEL in CD patients as compared to healthy controls aimed at characterization of altered IEL contribution to the pathogenesis of Crohn's disease. The peripheral venous blood and colon tissues were obtained from 10 CD patients and 6 donors. IEL were isolated from the mucosa by incubation the tissue in a predigesting solution. Lymphoid cells phenotype was investigated using monoclonal antibodies and flow cytometry. The majority of colonic IEL was identified as СD3+T lymphocytes and no significant differences were found in their numbers in investigated groups. However, changes in T cell subsets composition have been shown: the ratio of СD3+СD4+IEL and СD3+СD8+IEL was 1:1 in colon of CD patients and correlated with T cells in peripheral blood (R = 0.7; p < 0.05) while donor tissues were characterized by expected СD3+СD8+T killers prevalence and the ratio reached 1:2 (p < 0.05). The increase of unconventional γδIEL (mainly due to V81+T cells) and СD161+T cells in association with TNK cells decrease were revealed in colon (p < 0.01) as well as in peripheral blood (p < 0.05) of CD patients as compared to donors. Moreover, the number of colonic γδIEL was correlated with disease location (R = -0.6; p < 0.05), and disease behavior (R = 0.7; p < 0.01) according to Montreal classification. The observed data indicates changes in colonic IEL composition in CD patients that may provide valuable insight into the contribution of T helpers, γδT cells and mucosa-associated СD161+T cells in autoimmune intestinal inflammation but need further possible mechanisms discussion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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