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Enregistrement W4381047089 · doi:10.1002/cam4.6216

Clinical analysis of EV‐Fingerprint to predict grade group 3 and above prostate cancer and avoid prostate biopsy

2023· article· en· W4381047089 sur OpenAlexafffund
Adrian Fairey, Robert J. Paproski, Desmond Pink, Deborah Sosnowski, Catalina Vásquez, Bryan Donnelly, Eric Hyndman, Armen Aprikian, Adam Kinnaird, Perrin H. Beatty, John D. Lewis

Notice bibliographique

RevueCancer Medicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensMontreal General HospitalAlberta Oil Sands Technology and Research AuthorityProstate Cancer CanadaMcGill UniversityUniversity of CalgaryUniversity of AlbertaAlberta Hip and Knee Clinic
Organismes subventionnairesAlberta InnovatesProstate Cancer CanadaAlberta Cancer Foundation
Mots-clésProstate cancerMedicineProstateBiopsyProstate biopsyCutoffLogistic regressionBiomarkerProstate-specific antigenInternal medicineArea under the curveCancerProspective cohort studyCohortUrologyOncology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: There is an unmet clinical need for minimally invasive diagnostic tests to improve the detection of grade group (GG) ≥3 prostate cancer relative to prostate antigen-specific risk calculators. We determined the accuracy of the blood-based extracellular vesicle (EV) biomarker assay (EV Fingerprint test) at the point of a prostate biopsy decision to predict GG ≥3 from GG ≤2 and avoid unnecessary biopsies. METHODS: This study analyzed 415 men referred to urology clinics and scheduled for a prostate biopsy, were recruited to the APCaRI 01 prospective cohort study. The EV machine learning analysis platform was used to generate predictive EV models from microflow data. Logistic regression was then used to analyze the combined EV models and patient clinical data and generate the patients' risk score for GG ≥3 prostate cancer. RESULTS: The EV-Fingerprint test was evaluated using the area under the curve (AUC) in discrimination of GG ≥3 from GG ≤2 and benign disease on initial biopsy. EV-Fingerprint identified GG ≥3 cancer patients with high accuracy (0.81 AUC) at 95% sensitivity and 97% negative predictive value. Using a 7.85% probability cutoff, 95% of men with GG ≥3 would have been recommended a biopsy while avoiding 144 unnecessary biopsies (35%) and missing four GG ≥3 cancers (5%). Conversely, a 5% cutoff would have avoided 31 unnecessary biopsies (7%), missing no GG ≥3 cancers (0%). CONCLUSIONS: EV-Fingerprint accurately predicted GG ≥3 prostate cancer and would have significantly reduced unnecessary prostate biopsies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,077
Score d'incertitude au seuil0,944

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,380
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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