Analysis of Plasmodium falciparum Resistance to Chloroquine in Côte d'Ivoire after 20 Years: High Prevalence of Wild Strains
Notice bibliographique
Résumé
Malaria is a major public health problem worldwide, especially in Africa, where antimalarial drug-resistant strains are spreading. In Côte d'Ivoire, Dihydro-artemisinine Piperaquine (DHA-PPQ) has been included in the policy for simple malaria management, but key mutations of the pfcrt gene are being studied to determine the mutation points that modulate Plasmodium falciparum resistance to Piperaquine. Genomic DNA from 158 patients from the five study sites with P.falciparum malaria was extracted using Chelex 5% tween. Conventional PCR amplification of the pfcrt gene was followed by Sanger sequencing of the amplificates on the Sanger sequencing platform of the CRCHU of Quebec (Canada). Comparison of different proportions was carried out using Rstudio software version 4.1.3. Analysis of individual alleles showed a prevalence of wild strain alleles over mutant alleles at all study sites. The K76T mutation was found at relatively low prevalences at the sites: 4.5% (1/22) in Bouaké; 10% (2/20) in Yamoussoukro; 18.5% (4/20) in Ayame; 20% (5/27) in Man and 34.8% (24/69) in Anonkoua-koute. Analysis of the distribution of the wild strain haplotype (CVMNK) of the pfcrt gene showed a high proportion (55-80% prevalence) compared to mutant strain haplotypes (1-20% prevalence). The high prevalence of the CVMNK haplotype across all sentinel sites supports the potential for regained sensitivity to CQ in the treatment of simple malaria. Therefore, continued molecular surveillance and in vitro analysis of pfcrt gene polymorphism mutations is highly recommended.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».