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Enregistrement W4381376375 · doi:10.2337/db23-317-or

317-OR: Metabolomic Analyses Identify Novel Predictors of Diabetic Kidney Disease in Youth-Onset Type 2 Diabetes

2023· article· en· W4381376375 sur OpenAlexaboutno aff
Laura Pyle, Tim Vigers, Laure El ghormli, IAN DE BOER, Robert G. Nelson, Sushrut S. Waikar, Hiddo J.L. Heerspink, Neil H. White, Kalie L. Tommerdahl, Lori M. Laffel, AMY S. SHAH, KIMBERLY DREWS, Justin R. Ryder, Rose Gubitosi‐Klug, Kumar Sharma, Petter Bjornstad

Notice bibliographique

RevueDiabetes · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlbuminuriaMedicineUrineCreatinineInternal medicineType 2 diabetesKidney diseaseDiabetes mellitusRenal functionEndocrinologyMetaboliteDialysisUrology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Diabetic kidney disease (DKD) develops by young adulthood in up to 50% of people with youth-onset type 2 diabetes (Y-T2D), increasing risk of dialysis and premature death. Understanding mechanisms responsible for early DKD is key to management and prevention; accordingly, we sought to identify metabolite signatures of DKD in Y-T2D. Methods: We measured 57 metabolites in 374 baseline plasma and urine samples from the Treatment Options for type 2 Diabetes in Adolescents and Youth (TODAY) study, using mass spectrometry with a targeted ZipChip based assay. Urine albumin-to-creatinine ratio (UACR) was assessed annually for up to 15 years. Incident moderate and severe albuminuria were defined as UACR ≥30 and ≥300 mg/g, respectively, on ≥2 of 3 measures. We evaluated prediction of moderate and severe albuminuria in separate Cox proportional hazards models adjusted for HbA1c, triglycerides, systolic blood pressure, and estimated insulin sensitivity. Urine metabolites were normalized by urine creatinine. Results: Participants were 14±2 years of age, 37% male; 43% developed either moderate or severe albuminuria. Four urine metabolites predicted time to moderate albuminuria, while 8 urine metabolites predicted time to severe albuminuria, with 3 metabolites in common: 2-hydroxybutyric acid (moderate: HR: 0.82 per 1 SD [95% CI 0.70, 0.96]; severe: 0.70 [0.55, 0.88]), glycine (moderate: 0.81 [0.69, 0.94]; severe: 0.62 [0.45, 0.85]), citric acid (moderate: 0.78 [0.67, 0.91]; severe: 0.76 [0.58, 0.99]). Four plasma metabolites predicted time to moderate albuminuria and severe albuminuria, such as glutamic acid for moderate albuminuria (1.23 [1.03, 1.47]) and citric acid for severe albuminuria (1.39 [1.09, 1.77]). Conclusion: Higher urine metabolites involved in mitigating oxidative stress (glycine), glomerular epithelial cell injury (2-hydroxybutyric acid) and preserving mitochondrial function (citrate) predicted lower risk of albuminuria in Y-T2D. Disclosure L.Pyle: None. L.M.Laffel: Advisory Panel; Medtronic, Lilly Diabetes, Novo Nordisk, Vertex Pharmaceuticals Incorporated, Roche Diagnostics, Provention Bio, Inc., Consultant; Dexcom, Inc., Janssen Pharmaceuticals, Inc., Medscape. A.S.Shah: None. K.Drews: None. J.R.Ryder: None. R.Gubitosi-klug: None. K.Sharma: Advisory Panel; Reata Pharmaceuticals, Inc., Otsuka America Pharmaceutical, Inc. P.Bjornstad: Advisory Panel; AstraZeneca, Novo Nordisk, Lilly, Horizon Therapeutics plc, Boehringer Ingelheim (Canada) Ltd., LG Chem, Consultant; Bayer Inc., Bristol-Myers Squibb Company. T.B.Vigers: None. L.El ghormli: None. I.De boer: Advisory Panel; AstraZeneca, Boehringer Ingelheim and Eli Lilly Alliance, Boehringer Ingelheim International GmbH, Otsuka America Pharmaceutical, Inc., Bayer Inc., Consultant; George Clinical, Gilead Sciences, Inc., Medscape, Research Support; Dexcom, Inc. R.G.Nelson: None. S.Waikar: None. H.L.Heerspink: Consultant; AstraZeneca, Boehringer Ingelheim International GmbH, Bayer Inc., Eli Lilly and Company, Chinook Therapeutics Inc., CSL Behring, Gilead Sciences, Inc., George Clinical, Merck & Co., Inc., Janssen Research & Development, LLC, Traveere Pharmaceuticals, Novo Nordisk. N.White: None. K.L.Tommerdahl: None. Funding National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases (U01DK61242)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,037

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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