319-OR: Effect of Vertical Sleeve Gastrectomy (VSG) on the Kidney Transcriptome of Youth with Type 2 Diabetes (T2D)
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: VSG attenuates early diabetic kidney disease (DKD) in youth with T2D, yet the molecular mechanisms of VSG on kidney health are unknown. We analyzed single-cell RNA sequencing data from paired kidney biopsies obtained from youth with T2D before and 1-year after VSG. Methods: Data from 5 youths with T2D who underwent kidney biopsies before and after VSG were included in this analysis (pre-VSG:17±2 years, HbA1c 7.5±2.6%, BMI 41±3 kg/m2, 40% with albuminuria (UACR≥30mg/g). A total of 23598 cells were profiled from the five paired kidney biopsies, with 19735 cells from 12 HC. Cell selective differentially expressed genes in disease (T2D vs. HC) were computed. Disease genes that reversed directionality post-VSG were termed "suppressed by VSG" or "upregulated by VSG," depending on the direction of the reversal. Results: VSG resulted in the normalization of HbA1c and UACR in all cases at 12 months. Post VSG, 73% of proximal tubule (PT) genes that were upregulated in T2D vs. HC were suppressed in VSG vs. T2D. These suppressed genes were enriched for glycolysis, gluconeogenesis, and TCA cycle pathways (Figure). Gene and pathway changes in the PT were similar to what was recently demonstrated with SGLT2i in T2D youth. Conclusion: VSG, like SGLT2i, is associated with reduced central carbon metabolism in the PT and other nephron segments. Disclosure A.Naik: Advisory Panel; CareDx. K.N.Z.Fuller: None. P.E.Ladd: None. D.A.Sandoval: Consultant; Metis Therapeutics. S.Gross: None. P.Zeitler: Consultant; Eli Lilly and Company, Boehringer Ingelheim Inc., Johnson & Johnson. K.J.Nadeau: None. J.R.Ryder: None. T.Inge: None. J.B.Hodgin: None. F.C.Brosius: Advisory Panel; Gilead Sciences, Inc. F.Alakwaa: None. R.G.Nelson: None. M.Kretzler: Research Support; Lilly, Boehringer Ingelheim Inc., Traveere Pharmaceuticals, Novo Nordisk, certa, Chinook Therapeutics Inc., Janssen Research & Development, LLC, AstraZeneca, Moderna, Inc., Gilead Sciences, Inc., Regeneron, Ionis Pharmaceuticals, Angioin, Renalytix. P.Bjornstad: Advisory Panel; AstraZeneca, Novo Nordisk, Lilly, Horizon Therapeutics plc, Boehringer Ingelheim (Canada) Ltd., LG Chem, Consultant; Bayer Inc., Bristol-Myers Squibb Company. J.A.Schaub: None. P.J.Mccown: None. V.Nair: None. S.Eddy: None. L.Pyle: None. T.B.Vigers: None. M.M.Kelsey: Other Relationship; Boehringer Ingelheim Inc., Janssen Pharmaceuticals, Inc., Rhythm Pharmaceuticals, Inc., Lilly. Funding Boettcher Foundation; National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases (K23116720, R01DK129211); JDRF (2-SRA-2019-845-S-B)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».