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Enregistrement W4381431186 · doi:10.3233/sw-233207

Reuse of the FoodOn ontology in a knowledge base of food composition data

2023· article· en· W4381431186 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueSemantic Web · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiomedical Text Mining and Ontologies
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSPARQLLeverage (statistics)Computer scienceOntologyIdentifierKnowledge baseLinked dataFood composition dataRDFReuseComposition (language)World Wide WebInformation retrievalDomain (mathematical analysis)Data scienceSemantic WebFood scienceArtificial intelligenceBiologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We describe our work to integrate the FoodOn ontology with our knowledge base of food composition data, WikiFCD. WikiFCD is knowledge base of structured data related to food composition and food items. With a goal to reuse FoodOn identifiers for food items, we imported a subset of the FoodOn ontology into the WikiFCD knowledge base. We aligned the import via a shared use of NCBI taxon identifiers for the taxon names of the plants from which the food items are derived. Reusing FoodOn benefits WikiFCD by allowing us to leverage the food item groupings that FoodOn contains. This integration also has potential future benefits for the FoodOn community due to the fact that WikiFCD provides food composition data at the food item level, and that WikiFCD is mapped to Wikidata and contains a SPARQL endpoint that supports federated queries. Federated queries across WikiFCD and Wikidata allow us to ask questions about food items that benefit from the cross-domain information of Wikidata, greatly increasing the breadth of possible data combinations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,143
Score d'incertitude au seuil0,190

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle