Systemic Blood Proteome Patterns Reflect Disease Phenotypes in Neovascular Age-Related Macular Degeneration
Notice bibliographique
Résumé
There is early evidence of extraocular systemic signals effecting function and morphology in neovascular age-related macular degeneration (nAMD). The prospective, cross-sectional BIOMAC study is an explorative investigation of peripheral blood proteome profiles and matched clinical features to uncover systemic determinacy in nAMD under anti-vascular endothelial growth factor intravitreal therapy (anti-VEGF IVT). It includes 46 nAMD patients stratified by the level of disease control under ongoing anti-VEGF treatment. Proteomic profiles in peripheral blood samples of every patient were detected with LC-MS/MS mass spectrometry. The patients underwent extensive clinical examination with a focus on macular function and morphology. In silico analysis includes unbiased dimensionality reduction and clustering, a subsequent annotation of clinical features, and non-linear models for recognition of underlying patterns. The model assessment was performed using leave-one-out cross validation. The findings provide an exploratory demonstration of the link between systemic proteomic signals and macular disease pattern using and validating non-linear classification models. Three main results were obtained: (1) Proteome-based clustering identifies two distinct patient subclusters with the smaller one (n = 10) exhibiting a strong signature for oxidative stress response. Matching the relevant meta-features on the individual patient’s level identifies pulmonary dysfunction as an underlying health condition in these patients. (2) We identify biomarkers for nAMD disease features with Aldolase C as a putative factor associated with superior disease control under ongoing anti-VEGF treatment. (3) Apart from this, isolated protein markers are only weakly correlated with nAMD disease expression. In contrast, applying a non-linear classification model identifies complex molecular patterns hidden in a high number of proteomic dimensions determining macular disease expression. In conclusion, so far unconsidered systemic signals in the peripheral blood proteome contribute to the clinically observed phenotype of nAMD, which should be examined in future translational research on AMD.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».