Higher convergence of human-great ape enteric eukaryotic viromes in central African forest than in a European zoo: a One Health analysis
Notice bibliographique
Résumé
Human-animal pathogenic transmissions threaten both human and animal health, and the processes catalyzing zoonotic spillover and spillback are complex. Prior field studies offer partial insight into these processes but overlook animal ecologies and human perceptions and practices facilitating human-animal contact. Conducted in Cameroon and a European zoo, this integrative study elucidates these processes, incorporating metagenomic, historical, anthropological and great ape ecological analyses, and real-time evaluation of human-great ape contact types and frequencies. We find more enteric eukaryotic virome sharing between Cameroonian humans and great apes than in the zoo, virome convergence between Cameroonian humans and gorillas, and adenovirus and enterovirus taxa as most frequently shared between Cameroonian humans and great apes. Together with physical contact from hunting, meat handling and fecal exposure, overlapping human cultivation and gorilla pillaging in forest gardens help explain these findings. Our multidisciplinary study identifies environmental co-use as a complementary mechanism for viral sharing.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».