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Enregistrement W4381547368 · doi:10.1016/j.xcrm.2023.101085

Integrating genetics and metabolomics from multi-ethnic and multi-fluid data reveals putative mechanisms for age-related macular degeneration

2023· article· en· W4381547368 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueCell Reports Medicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRetinal Diseases and Treatments
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute on Deafness and Other Communication DisordersNational Cancer InstituteGénome QuébecNational Eye InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteFundação para a Ciência e a TecnologiaFonds de Recherche du Québec - SantéNational Institutes of HealthPublic Health AgencyEuropean CommissionKing's College LondonJewish General HospitalNational Institute for Health and Care ResearchCancer Research UKWellcome TrustHope FoundationCanada Foundation for InnovationCanadian Institutes of Health ResearchCompute CanadaNational Health and Medical Research CouncilPublic Health Agency of CanadaNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesMcGill UniversityMedical Research CouncilBiogen
Mots-clésMendelian randomizationMacular degenerationMetabolomicsMetabolomeBiologyGenetic associationGeneticsGenome-wide association studyMetaboliteComputational biologyBioinformaticsGeneMedicineGenotypeGenetic variantsSingle-nucleotide polymorphismBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Age-related macular degeneration (AMD) is a leading cause of blindness in older adults. Investigating shared genetic components between metabolites and AMD can enhance our understanding of its pathogenesis. We conduct metabolite genome-wide association studies (mGWASs) using multi-ethnic genetic and metabolomic data from up to 28,000 participants. With bidirectional Mendelian randomization analysis involving 16,144 advanced AMD cases and 17,832 controls, we identify 108 putatively causal relationships between plasma metabolites and advanced AMD. These metabolites are enriched in glycerophospholipid metabolism, lysophospholipid, triradylcglycerol, and long chain polyunsaturated fatty acid pathways. Bayesian genetic colocalization analysis and a customized metabolome-wide association approach prioritize putative causal AMD-associated metabolites. We find limited evidence linking urine metabolites to AMD risk. Our study emphasizes the contribution of plasma metabolites, particularly lipid-related pathways and genes, to AMD risk and uncovers numerous putative causal associations between metabolites and AMD risk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,845
Score d'incertitude au seuil0,752

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,100
Tête enseignante GPT0,365
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle