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Enregistrement W4381715178 · doi:10.1158/1055-9965.epi-23-0453

Genetic Susceptibility to Nonalcoholic Fatty Liver Disease and Risk for Pancreatic Cancer: Mendelian Randomization

2023· article· en· W4381715178 sur OpenAlexaff
Sontoria D. King, Swathi Veliginti, Martijn C.G.J. Brouwers, Zhewen Ren, Wei Zheng, Veronica Wendy Setiawan, Lynne R. Wilkens, Xiao‐Ou Shu, Alan A. Arslan, Laura E. Beane Freeman, Paige M. Bracci, Federico Canzian, Mengmeng Du, Steven Gallinger, Graham G. Giles, Phyllis J. Goodman, Christopher A. Haiman, Manolis Kogevinas, Charles Kooperberg, Loı̈c Le Marchand, Rachel Ε. Neale, Kala Visvanathan, Emily White, Demetrius Albanes, Gabriella Andreotti, Ana Babić, Sonja I. Berndt, Lauren K. Brais, Paul Brennan, Julie E. Buring, Kari G. Rabe, William R. Bamlet, Stephen J. Chanock, Charles S. Fuchs, J. Michael Gaziano, Edward L. Giovannucci, Thilo Hackert, Manal M. Hassan, Verena Katzke, Robert C. Kurtz, I‐Min Lee, Núria Malats, Neil Murphy, Ann L. Oberg, Irene Orlow, Miquel Porta, Francisco X. Real, Nathaniel Rothman, Howard D. Sesso, Debra T. Silverman, Ian M. Thompson, Jean Wactawski‐Wende, Xiaoliang Wang, Nicolas Wentzensen, Herbert Yu, Anne Zeleniuch‐Jacquotte, Kai Yu, Brian M. Wolpin, Eric J. Duell, Donghui Li, Rayjean J. Hung, Sandra Pérdomo, Marjorie L. McCullough, Neal D. Freedman, Alpa V. Patel, Ulrike Peters, Elio Ríboli, Malin Sund, Anne Tjønneland, Jun Zhong, Stephen K. Van Den Eeden, Peter Kraft, Harvey A. Risch, Laufey T. Ámundadóttir, Alison P. Klein, Rachael Z. Stolzenberg‐Solomon, Samuel O. Antwi

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver Disease Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of HealthDivision of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer InstituteWorld Health Organization
Mots-clésMendelian randomizationPancreatic cancerNonalcoholic fatty liver diseaseInternal medicineMedicineGenetic predispositionGenome-wide association studyGastroenterologyCancerOdds ratioGenetic modelOncologyDiseaseSingle-nucleotide polymorphismFatty liverGenotypeGeneticsBiologyGenetic variants

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: There are conflicting data on whether nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) is associated with susceptibility to pancreatic cancer. Using Mendelian randomization (MR), we investigated the relationship between genetic predisposition to NAFLD and risk for pancreatic cancer. METHODS: Data from genome-wide association studies (GWAS) within the Pancreatic Cancer Cohort Consortium (PanScan; cases n = 5,090, controls n = 8,733) and the Pancreatic Cancer Case Control Consortium (PanC4; cases n = 4,163, controls n = 3,792) were analyzed. We used data on 68 genetic variants with four different MR methods [inverse variance weighting (IVW), MR-Egger, simple median, and penalized weighted median] separately to predict genetic heritability of NAFLD. We then assessed the relationship between each of the four MR methods and pancreatic cancer risk, using logistic regression to calculate ORs and 95% confidence intervals (CI), adjusting for PC risk factors, including obesity and diabetes. RESULTS: No association was found between genetically predicted NAFLD and pancreatic cancer risk in the PanScan or PanC4 samples [e.g., PanScan, IVW OR, 1.04; 95% confidence interval (CI), 0.88-1.22; MR-Egger OR, 0.89; 95% CI, 0.65-1.21; PanC4, IVW OR, 1.07; 95% CI, 0.90-1.27; MR-Egger OR, 0.93; 95% CI, 0.67-1.28]. None of the four MR methods indicated an association between genetically predicted NAFLD and pancreatic cancer risk in either sample. CONCLUSIONS: Genetic predisposition to NAFLD is not associated with pancreatic cancer risk. IMPACT: Given the close relationship between NAFLD and metabolic conditions, it is plausible that any association between NAFLD and pancreatic cancer might reflect host metabolic perturbations (e.g., obesity, diabetes, or metabolic syndrome) and does not necessarily reflect a causal relationship between NAFLD and pancreatic cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,034
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,075
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,181

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0340,075
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,317 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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