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Enregistrement W4381735654 · doi:10.14785/lymphosign-2023-0007

Novel heterozygous mutation in <i>NFKB2</i> in a patient with predominantly antibody deficiency

2023· article· en· W4381735654 sur OpenAlexaffvenue
Azhar Al Shaqaq, Amarilla B. Mandola

Notice bibliographique

RevueLymphoSign Journal · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCommon variable immunodeficiencyImmune systemAntibodyGerminal centerMutationImmunodeficiencyBiologyImmunologyGeneticsGeneMedicineB cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The Nuclear Factor-kappa B (NF-kB) signaling pathway plays a critical role in regulating a wide range of cellular processes such as immune function, inflammation, and tumor regulation. There are two major pathways that play a role in NF-kB activation: the canonical NF-kB1 pathway and the non-canonical NF-kB2 pathway. Abnormalities in non-canonical NF-κB2 signaling are linked with significant impairments in the immune system, mainly B cell maturation, antibody production, as well as T helper and regulatory T cell function through its effect on germinal center regulation. Methods: Our patient’s medical record was analyzed retrospectively, including her medical history, results from immune laboratory tests, and genetic analyses. Results: We present a 16-year-old female with a history of chronic cough complicated with episodes of hemoptysis and diagnosed with bronchiectasis secondary to common variable immunodeficiency. Whole exome sequencing analysis revealed a novel heterozygous variant in the NFKB2 gene (NM_001077494.3), c.931C>T resulting in p.Arg311Cys. Conclusion: The presence of NFKB2 mutations can lead to the development of early-onset common variable immunodeficiency. Statement of Novelty: We have identified a novel variant in the NFKB2 gene associated with antibody deficiency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0030,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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