Personalized multi-marker panel in the risk assessment of atopic dermatitis phenotypes in children
Notice bibliographique
Résumé
Introduction This paper reports the study of a combined genetic and biomarker panel for assessing the risk of development of different phenotypes of atopic dermatitis (AD) in children: alone and combined with other atopic disorders (AtD) – allergic rhinitis/rhino-conjunctivitis (AR/ARC) and bronchial asthma (BA). The aim was to establish a personalized diagnostic multi-marker panel for assessing the developmental risk of different AD phenotypes in children combining single nucleotide polymorphism (SNP) rs_7927894 filaggrin (FLG) genotype variants, serum levels of total immune globulin E (IgE), cutaneous T-cell attracting chemokine (CTACK/CCL27) and thymus and activation regulated chemokine (TARC/CCL17). Material and methods The study recruited patients aged 3–18 years old: 39 atopic patients to the main group and 47 non-atopic patients to the control group. All the patients were tested for SNP variants of rs_7927894 FLG and serum concentrations of total IgE, CTACK/CCL27 and TARC/CCL17. Results Within AD alone phenotype patients we detected the following significant risk ratios: cytosinethymine (C/T) rs_7927894 FLG [odds ratio (OR) = 4.14, p < 0.05], total IgE > 173 IU/ml (OR = 8.98, p < 0.001), CTACK/ CCL27 > 3658.5 pg/ml (OR = 5.64, p < 0.01). Atopic disorders combined with other AtD phenotype: C/T rs_7927894 FLG (OR = 2.88, p < 0.05), total IgE > 213 IU/ml (OR = 136.7, p < 0.001), CTACK/CCL27 > 4308.8 pg/ml (OR = 7.40, p < 0.001). With AD combined with other AtD collated to AD alone – total IgE > 1001 IU/ml (OR = 16.0, p < 0.001). TARC/CCL17 had no significant differences among main and control groups. Conclusions Cytosinethymine rs_7927894 FLG variant combined with cut-off serum IgE and CTACK/CCL27 levels is a novel significant personalized multi-marker panel for assessing the risk of development of the different AD phenotypes in children.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».