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Enregistrement W4381805114 · doi:10.1038/s41598-023-36928-1

A collaborative and near-comprehensive North Pacific humpback whale photo-ID dataset

2023· article· en· W4381805114 sur OpenAlexaff
Ted Cheeseman, Ken Southerland, Jo Marie Acebes, Katherina Audley, Jay Barlow, Lars Bejder, Caitlin Birdsall, Amanda L. Bradford, Josie Byington, John Calambokidis, Rachel Cartwright, Jen Cedarleaf, Andrea Jacqueline García Chávez, Jens J. Currie, Joëlle De Weerdt, Nicole Doe, Thomas Doniol‐Valcroze, Karina Dracott, Olga A. Filatova, Rachel Finn, Kiirsten Flynn, John K. B. Ford, Astrid Frisch‐Jordán, Christine M. Gabriele, Beth Goodwin, Craig Hayslip, Jackie Hildering, Marie C. Hill, Jeff K. Jacobsen, M. Esther Jiménez-López, Meagan Jones, Nozomi Kobayashi, Edward Lyman, Mark Malleson, Evgeny Mamaev, Pamela Martínez Loustalot, Annie Masterman, Craig O. Matkin, Christie J. McMillan, Jeff E. Moore, John R. Moran, Janet L. Neilson, Hayley Newell, Haruna Okabe, Marilia Olio, Adam A. Pack, Daniel M. Palacios, Heidi C. Pearson, Ester Quintana‐Rizzo, Raúl Fernando Ramírez Barragán, Nicola Ransome, Hiram Rosales‐Nanduca, Fred Sharpe, Tasli Shaw, Stephanie H. Stack, Iain J. Staniland, Janice M. Straley, Andrew Szabo, Suzie S Teerlink, Olga Titova, Jorge Urban R., Martin van Aswegen, Marcel Vinicius de Morais, Olga von Ziegesar, Briana Witteveen, Janie Wray, Kymberly M. Yano, Denny Zwiefelhofer, Phil Clapham

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine animal studies overview
Établissements canadiensFisheries and Oceans CanadaAsia Pacific Foundation of CanadaThe Arctic Eider Society
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHumpback whaleWhaleOceanographyFisheryGeographyData scienceComputer scienceGeologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We present an ocean-basin-scale dataset that includes tail fluke photographic identification (photo-ID) and encounter data for most living individual humpback whales (Megaptera novaeangliae) in the North Pacific Ocean. The dataset was built through a broad collaboration combining 39 separate curated photo-ID catalogs, supplemented with community science data. Data from throughout the North Pacific were aggregated into 13 regions, including six breeding regions, six feeding regions, and one migratory corridor. All images were compared with minimal pre-processing using a recently developed image recognition algorithm based on machine learning through artificial intelligence; this system is capable of rapidly detecting matches between individuals with an estimated 97-99% accuracy. For the 2001-2021 study period, a total of 27,956 unique individuals were documented in 157,350 encounters. Each individual was encountered, on average, in 5.6 sampling periods (i.e., breeding and feeding seasons), with an annual average of 87% of whales encountered in more than one season. The combined dataset and image recognition tool represents a living and accessible resource for collaborative, basin-wide studies of a keystone marine mammal in a time of rapid ecological change.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,098
Score d'incertitude au seuil0,196

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,005
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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