Short‐chain polyphosphates: Extraction effects on migration and size estimation of <i>Saccharomyces cerevisiae</i> extracts with polyacrylamide gel electrophoresis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Polyacrylamide gel electrophoresis is commonly used to characterize the chain length of polyphosphates (polyP), more generally called condensed phosphates. After separation, nonradioactive, optical polyP staining is limited to chain lengths greater than 15 monomers with toluidine blue or 4′,6‐diamidino‐2‐phenylindole. PolyP chain lengths longer than 62monomers were correlated to the shortest DNA ladders. In this study, synthetic linear polyPs (Sigma‐Aldrich “Type 45”, estimated mean length of 45 monomers), trimetaphosphate (trimetaP: 3 ring), tripolyphosphate (tripolyP), pyrophosphate (PP i ), and inorganic orthophosphate (o‐P i ) were visualized after separation by an in situ hydrolytic degradation process to o‐P i that was subsequently stained with methyl green. Statistically insignificant migration reduction of synthetic short‐chain polyP after perchloric acid or phenol–chloroform extraction was confirmed with the Friedman test. 31 P diffusion–ordered NMR spectroscopy confirmed that extraction also reduced PP i diffusivity by <10%. Linear regression between the R f peak migration value and the logarithm of synthetic polyP molecular weights enabled estimation of extracted polyP chain lengths from 2 to 45 monomers. Linear polyP extracts from Saccharomyces cerevisiae grown in aerobic conditions were generally shorter than extracts cultured in anaerobic conditions. Extractions from both aerobic and anaerobic S. cerevisiae included tripolyP and o‐P i , but no PP i .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».