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Enregistrement W4381839637 · doi:10.1002/ajmg.a.63337

Five siblings expand the spectrum of <i>GPC6</i>‐related skeletal dysplasia

2023· article· en· W4381839637 sur OpenAlexaff
Molly M. Crenshaw, Mariana L. Meyers, Kathleen Brown, Valerie Slegesky, Jessica Duis, Ellen Roy Elias, Margarita Sáenz, Wen Shi, Jorge Filmus, Naomi Meeks

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Syndromes and Imprinting
Établissements canadiensUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhenotypeMissense mutationShort statureDysplasiaBiologyProbandGeneticsEndocrinologyMedicineInternal medicineGeneMutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Skeletal dysplasias broadly include disorders of cartilage or bone. Omodysplasia-1 is a type of skeletal dysplasia caused by biallelic loss of function variants in the GPC6 gene. GPC6 codes for the protein glypican 6 (GPC6) (OMIM *604404), which stimulates bone growth. We report a family in which five out of nine children were presented with a skeletal dysplasia characterized phenotypically by mild short stature and rhizomelia. All affected individuals were found to have homozygous missense variants in GPC6: c.511 C>T (p.Arg171Trp). Radiograph findings included rhizomelic foreshortening of all four extremities, coxa breva, and ulna minus deformity. Using a Hedgehog (Hh) reporter assay, we demonstrate that the variant found in this family results in significantly reduced stimulation of Hh activity when compared to the wild-type GPC6 protein, however protein function is still present. Thus, the milder phenotype seen in the family presented is hypothesized due to decreased GPC6 protein activity versus complete loss of function as seen in omodysplasia-1. Given the unique phenotype and molecular mechanism, we propose that this family's findings widen the phenotypic spectrum of GPC6-related skeletal dysplasias.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,451
Score d'incertitude au seuil0,439

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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