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Enregistrement W4381852553 · doi:10.1101/2023.06.18.23291542

An explainable machine learning-based phenomapping strategy for adaptive predictive enrichment in randomized controlled trials

2023· preprint· en· W4381852553 sur OpenAlexfundno aff
Evangelos K. Oikonomou, Phyllis Thangaraj, Deepak L. Bhatt, Joseph S. Ross, Lawrence H. Young, Harlan M. Krumholz, Marc A. Suchard, Rohan Khera

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods in Clinical Trials
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCenter of Excellence in Regulatory Science and InnovationJanssen Research and DevelopmentNational Institutes of HealthHLS TherapeuticsIdorsia PharmaceuticalsEisaiModernaShenzhen Center for Health InformationSt. Jude MedicalRegeneron PharmaceuticalsEli Lilly and CompanyCSL BehringSanofiNovo NordiskMedicines CompanyBoston Scientific CorporationMyoKardiaYale UniversityIronwood Pharmaceuticals, IncorporatedNational Heart, Lung, and Blood InstitutePfizerAdvanced Micro Devices
Mots-clésRandomized controlled trialMedicineHazard ratioSprintBlood pressureInternal medicinePhysical therapyConfidence interval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Randomized controlled trials (RCT) represent the cornerstone of evidence-based medicine but are resource-intensive. We propose and evaluate a machine learning (ML) strategy of adaptive predictive enrichment through computational trial phenomaps to optimize RCT enrollment. In simulated group sequential analyses of two large cardiovascular outcomes RCTs of (1) a therapeutic drug (pioglitazone versus placebo; Insulin Resistance Intervention after Stroke (IRIS) trial), and (2) a disease management strategy (intensive versus standard systolic blood pressure reduction in the Systolic Blood Pressure Intervention Trial (SPRINT)), we constructed dynamic phenotypic representations to infer response profiles during interim analyses and examined their association with study outcomes. Across three interim timepoints, our strategy learned dynamic phenotypic signatures predictive of individualized cardiovascular benefit. By conditioning a prospective candidate’s probability of enrollment on their predicted benefit, we estimate that our approach would have enabled a reduction in the final trial size across ten simulations (IRIS: – 14.8% ± 3.1%, p one-sample t-test =0.001; SPRINT: –17.6% ± 3.6%, p one-sample t-test <0.001), while preserving the original average treatment effect (IRIS: hazard ratio of 0.73 ± 0.01 for pioglitazone vs placebo, vs 0.76 in the original trial; SPRINT: hazard ratio of 0.72 ± 0.01 for intensive vs standard systolic blood pressure, vs 0.75 in the original trial; all with p one-sample t-test <0.01). This adaptive framework has the potential to maximize RCT enrollment efficiency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,138
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,663
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Méta-épidémiologie (sens large)
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Essai randomisé · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,595
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1380,663
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0160,002
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,563
Tête enseignante GPT0,539
Écart entre enseignants0,025 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeEssai randomisé
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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