MYB-bHLH-TTG1 in a Multi-tiered Pathway Regulates <i>Arabidopsis</i> Seed Coat Mucilage Biosynthesis Genes Including <i>PECTIN METHYLESTERASE INHIBITOR14</i> Required for Homogalacturonan Demethylesterification
Notice bibliographique
Résumé
MYB-bHLH-TTG1 (MBW) transcription factor (TF) complexes regulate Arabidopsis seed coat biosynthesis pathways via a multi-tiered regulatory mechanism. The MYB genes include MYB5, MYB23 and TRANSPARENT TESTA2 (TT2), which regulate GLABRA2 (GL2), HOMEODOMAIN GLABROUS2 (HDG2) and TRANSPARENT TESTA GLABRA2 (TTG2). Here, we examine the role of PECTIN METHYLESTERASE INHIBITOR14 (PMEI14) in seed coat mucilage pectin methylesterification and provide evidence in support of multi-tiered regulation of seed coat mucilage biosynthesis genes including PMEI14. The PMEI14 promoter was active in the seed coat and developing embryo. A pmei14 mutant exhibited stronger attachment of the outer layer of seed coat mucilage, increased mucilage homogalacturonan demethylesterification and reduced seed coat radial cell wall thickness, results consistent with decreased PMEI activity giving rise to increased PME activity. Reduced mucilage release from the seeds of myb5, myb23, tt2 and gl2, hdg2, ttg2 triple mutants indicated that HDG2 and MYB23 play minor roles in seed coat mucilage deposition. Chromatin immunoprecipitation analysis found that MYB5, TT8 and seven mucilage pathway structural genes are directly regulated by MYB5. Expression levels of GL2, HDG2, TTG2 and nine mucilage biosynthesis genes including PMEI14 in the combinatorial mutant seeds indicated that these genes are positively regulated by at least two of those six TFs and that TTG1 and TTG2 are major regulators of PMEI14 expression. Our results show that MYB-bHLH-TTG1 complexes regulate mucilage biosynthesis genes, including PMEI14, both directly and indirectly via a three-tiered mechanism involving GL2, HDG2 and TTG2.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».