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Enregistrement W4382051129 · doi:10.1016/j.chembiol.2023.06.005

Identification of triazenyl indoles as inhibitors of fungal fatty acid biosynthesis with broad-spectrum activity

2023· article· en· W4382051129 sur OpenAlexafffund
Kali R. Iyer, Sheena C. Li, Nicole M. Revie, Jennifer W. Lou, Dustin Duncan, Sara Fallah, Hiram Sánchez, Iwona Skulska, Mojca Mattiazzi Ušaj, Hamid Safizadeh, Brett Larsen, Cassandra J. Wong, Ahmed Aman, Taira Kiyota, Mami Yoshimura, Hiromi Kimura, Hiroyuki Hirano, Minoru Yoshida, Hiroyuki Osada, Anne‐Claude Gingras, David R. Andes, Rebecca S. Shapiro, Nicole Robbins, Mohammad T. Mazhab‐Jafari, Luke Whitesell, Yoko Yashiroda, Charles Boone, Leah E. Cowen

Notice bibliographique

RevueCell chemical biology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health NetworkUniversity of TorontoToronto Metropolitan UniversityLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of GuelphOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanada Foundation for InnovationRIKENOntario GenomicsCanada Research ChairsNational Institutes of HealthCanadian Institute for Advanced ResearchJapan Society for the Promotion of ScienceGovernment of OntarioNational Institutes of Health, PakistanCanadian Institutes of Health ResearchGenome CanadaMerck
Mots-clésCandida albicansAspergillus fumigatusBiosynthesisBiologyMicrobiologyAzoleBiochemistryEnzymeAntifungal

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rising drug resistance among pathogenic fungi, paired with a limited antifungal arsenal, poses an increasing threat to human health. To identify antifungal compounds, we screened the RIKEN natural product depository against representative isolates of four major human fungal pathogens. This screen identified NPD6433, a triazenyl indole with broad-spectrum activity against all screening strains, as well as the filamentous mold Aspergillus fumigatus. Mechanistic studies indicated that NPD6433 targets the enoyl reductase domain of fatty acid synthase 1 (Fas1), covalently inhibiting its flavin mononucleotide-dependent NADPH-oxidation activity and arresting essential fatty acid biosynthesis. Robust Fas1 inhibition kills Candida albicans, while sublethal inhibition impairs diverse virulence traits. At well-tolerated exposures, NPD6433 extended the lifespan of nematodes infected with azole-resistant C. albicans. Overall, identification of NPD6433 provides a tool with which to explore lipid homeostasis as a therapeutic target in pathogenic fungi and reveals a mechanism by which Fas1 function can be inhibited.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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