A likely paleo-autotetraploidization event shaped the high conservation of Nyssaceae genome
Notice bibliographique
Résumé
Scientific knowledge about the ancestral genome of core eudicot plant kingdom can potentially have profound impacts on both basic and applied research, including evolution, genetics, genomics, ecology, agriculture, forestry, and global climate. To investigate which plant conserves best the core eudicots common ancestor genome, we compared Arcto-Tertiary relict Nyssaceae and 30 other eudicot plant families. The genomes of Davidia involucrata (a known living fossil), Camptotheca acuminata and Nyssa sinensis, one per existent genus of Nyssaceae, were performed comparative genomic analysis. We found that Nyssaceae originated from a single Nyssaceae common tetraploidization event (NCT) - autotetraploidization ∼28–31 Mya after the core eudicot common hexaploidization (ECH). We identified Nyssaceae orthologous and paralogous genes, determined its chromosomal evolutionary trajectory, and reconstructed the Nyssaceae most recent ancestor genome. D. involucrata genome contained the entire seven paleochromosomes and 17 ECH-generated eudicot common ancestor chromosomes and was the slowest in mutation among the analyzed 42 species of 31 plant families. Combing both its high retention of paleochromosomes and its low mutation rate, D. involucrata provides the best case in conservation of the core eudicot paleogenome.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».