Application of Same-Day Enterococcus qPCR-Based Analyses for Quality Assessment of Shorelines (Water and Sand) at Recreational Beaches
Notice bibliographique
Résumé
Rapid water-quality monitoring methods for beach water and sand can be helpful for public health authorities to develop comprehensive beach monitoring programs. In this study, we evaluated the performance of the Enterococcus qPCR (USEPA 1609.1) method for quality monitoring of beach water and sand-porewater at two Niagara region beaches in Ontario, Canada (Lakeside and Sunset Beaches). While the USEPA 1609.1 method has been validated for beach water, its potential for assessing associated beach sands (which may function as a microbial reservoir) has not been fully explored. All beach water samples (n = 168) passed the qPCR quality control (QC). However, only 20 out of 48 (41.7%) sand-porewater samples passed the qPCR QC, potentially due to interference by soluble inhibitors. The proportion of the sand-porewater samples passing QC improved slightly to 63 out of 120 (52.5%) with a prefiltration step to remove sand and other large particles. The faecal indicator density in the sand-porewater, tested in parallel, did not correlate with the beach water faecal indicator density. Comparing beach water data for the same-day Enterococcus qPCR threshold with the previous-day E. coli culturing-based threshold across all beach days tested, Enterococcus qPCR analyses identified 3 (7%) and 7 (16%) false positive/lost beach days for Lakeside and Sunset Beaches, respectively. Additionally, of the total beach days tested, Enterococcus qPCR analyses identified 2 (5%) and 1 (2%) false negative/health-risk days for Lakeside and Sunset Beaches, respectively. Sand-porewater testing analyses identified days when faecal indicators (in the sand) exceeded beach water quality thresholds. Compared with conventional E. coli culturing, use of the same-day qPCR method would result in fewer beach postings and could identify several additional health-risk days (when the beaches may not be posted). Future studies could include additional prefiltration steps or modifications in the Enterococcus qPCR protocol to improve the method’s applicability for sand quality monitoring.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».