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Enregistrement W4382140463 · doi:10.1039/d3cp01692g

Effect of oxidation on POPC lipid bilayers: anionic carboxyl group plays a major role

2023· article· en· W4382140463 sur OpenAlexafffund
Behnaz Bagheri, Phansiri Boonnoy, Jirasak Wong-ekkabut, Mikko Karttunen

Notice bibliographique

RevuePhysical Chemistry Chemical Physics · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesTechnische Universiteit EindhovenNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Research Council of ThailandUniversiteit UtrechtCanada Research Chairs
Mots-clésPOPCChemistryLipid bilayerBilayerMolecular dynamicsGroup (periodic table)MembraneComputational chemistryOrganic chemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

-3-phosphocholine (PazePC). Structural properties of the POPC lipid bilayer upon the addition of PoxnoPC or PazePC with concentration ranging from 10% to 30% were described. The key finding is that PazePC lipids bend their polar tails toward the bilayer-water interface whereas PoxnoPC lipids orient their tail toward the bilayer interior. The bilayer thickness decreases such that the thickness reduction in bilayers containing PazePC is stronger than in bilayers containing PoxnoPC. The average area per lipid decreases with a stronger effect in bilayers containing PoxnoPC. The addition of PoxnoPC makes both POPC acyl chains slightly more ordered whereas the addition of PazePC reduces the order in the two POPC acyl chains. These structural changes lead to an enhancement in the permeabilities of the bilayers containing these two oxidized products depending on the type, and the amount of oxidation. This enhancement can be achieved with a lower concentration of PazePC (10% or 15%), whereas a higher concentration of PoxnoPC (20%) is required to achieve an apparent enhancement in permeability. While the permeability of bilayers containing PazePC is higher than bilayers containing PoxnoPC in the 10-20% concentration range, by increasing the concentration of the oxidized products to higher than 20%, permeability of the bilayers containing PazePC is reduced such that it is slightly smaller than those containing PoxnoPC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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