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Enregistrement W4382198775 · doi:10.1101/2023.06.26.23291920

Automated Detection of Maternal Vascular Malperfusion Lesions of the Placenta using Machine Learning

2023· preprint· en· W4382198775 sur OpenAlexafffund
Purvasha Patnaik, Afsoon Khodee, Goutham Vasam, Anika Mukherjee, Sina Salsabili, Eranga Ukwatta, David Grynspan, Adrian D. C. Chan, Shannon Bainbridge

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePregnancy and preeclampsia studies
Établissements canadiensVernon Jubilee HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of British ColumbiaUniversity of GuelphCarleton UniversityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCalifornia HIV/AIDS Research Program
Mots-clésHistopathologyMedicinePlacentaSupport vector machineConfusionPreeclampsiaPathologyPregnancyObstetricsArtificial intelligenceFetusComputer scienceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction Hypertensive disorders of pregnancy (HDP) and fetal growth restriction (FGR) are common obstetrical complications, often with pathological features of maternal vascular malperfusion (MVM) in the placenta. Currently, clinical placental pathology methods involve a manual visual examination of histology sections, a practice that can be resource-intensive and demonstrate moderate-to-poor inter-pathologist agreement on diagnostic outcomes, dependant on the degree of pathologist sub-specialty training. Methods This study aims to apply machine learning (ML) feature extraction methods to classify digital images of placental histopathology specimens, collected from cases of HDP [gestational hypertension (GH), preeclampsia (PE), PE + FGR], normotensive FGR, and healthy pregnancies, according to the presence or absence of MVM lesions. 159 digital images were captured from histological placental specimens, manually scored for MVM lesions (MVM- or MVM+) and used to develop a support vector machine (SVM) classifier model, using features extracted from pretrained ResNet18. The model was trained with and without data augmentation, and with and without data shuffling, and the performance of the classifiers assessed and compared through measurements of accuracy, precision, and recall using confusion matrices. Results The SVM model demonstrated accuracies between 7-78% for WSI-level MVM classification, with poorest performance observed on images with borderline MVM presence, as determined through post hoc observation. Conclusion The results are promising for the integration of ML methods into the placental histopathological examination process. Using this study as a proof-of-concept will lead our group and others to carry ML models further in placental histopathology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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