A Significant Increasing Risk Association between Cigarette Smoking and XPA and XPC Genes Polymorphisms
Notice bibliographique
Résumé
Cigarette smoking (CS) is a major cause of various serious diseases due to tobacco chemicals. There is evidence suggesting that CS has been linked with the DNA damage repair system, as it can affect genomic stability, inducing genetic changes in the genes involved in the repair system, specifically the nucleotide excision repair (NER) pathway, affecting the function and/or regulation of these genes. Single nucleotide polymorphism (SNP), along with CS, can affect the work of the NER pathway and, therefore, could lead to different diseases. This study explored the association of four SNPs in both XPA and XPC genes with CS in the Saudi population. The Taq Man genotyping assay was used for 220 healthy non-smokers (control) and 201 healthy smokers to evaluate four SNPs in the XPA gene named rs10817938, rs1800975, rs3176751, and rs3176752 and four SNPs in the XPC gene called rs1870134, rs2228000, rs2228001, and rs2607775. In the XPA gene, SNP rs3176751 showed a high-risk association with CS-induced diseases with all clinical parameters, including CS duration, CS intensity, gender, and age of smokers. On the other hand, SNP rs1800975 showed a statistically significant low-risk association with all clinical parameters. In addition, rs10817938 showed a high-risk association only with long-term smokers and a low-risk association only with younger smokers. A low-risk association was found in SNP rs3176752 with older smokers. In the XPC gene, SNP rs2228001 showed a low-risk association only with female smokers. SNP rs2607775 revealed a statistically significant low-risk association with CS-induced diseases, concerning all parameters, except for male smokers. However, SNP rs2228000 and rs1870134 showed no association with CS. Overall, the study results demonstrated possible significant associations (effector/and protector) between CS and SNPs polymorphisms in DNA repair genes, such as XPA and XPC, except for rs2228000 and rs1870134 polymorphisms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».